结论：在劳动关系是与第三方公司签订的情况下，碰到工伤申请时，用人单位一般应填写与您签订劳动合同的第三方公司，但在某些特殊情况下，也可能涉及实际工作单位。以下为您详细分析：
一、一般情况：填写签订劳动合同的第三方公司
根据《工伤保险条例》及相关规定，工伤认定申请中的“用人单位”通常指的是与劳动者签订劳动合同、建立劳动关系的单位。在您的情况下，由于劳动关系是与第三方公司签订的，因此，在申请工伤认定时，用人单位一栏应填写该第三方公司的名称。这是因为，从法律关系的角度来看，是第三方公司与您建立了劳动关系，并承担了相应的雇主责任，包括工伤保险的缴纳和工伤事故的处理。
二、特殊情况：可能涉及实际工作单位
尽管在大多数情况下，用人单位应填写签订劳动合同的第三方公司，但也存在一些特殊情况，可能涉及实际工作单位：
劳务派遣情况：如果您是通过劳务派遣的方式被派遣到实际工作单位工作的，那么在实际发生工伤事故时，除了向签订劳动合同的劳务派遣单位申请工伤认定外，还可以根据具体情况，考虑是否将实际工作单位也纳入工伤认定的相关程序中（具体需根据当地政策及实际案情判断）。不过，在正式的工伤认定申请表中，用人单位一栏通常仍应填写劳务派遣单位。
关联企业或集团内部调动：在某些情况下，您可能与第三方公司签订劳动合同，但被安排到该公司的关联企业或集团内的其他公司工作。如果发生工伤事故，且这些关联企业或集团内部公司对工伤事故的发生负有直接责任，那么在实际处理过程中，可能会涉及这些实际工作单位。然而，在工伤认定申请时，用人单位一栏仍应填写签订劳动合同的第三方公司，但可以在申请过程中或后续处理中，根据实际情况，与相关部门沟通并说明情况。
三、法律建议
及时申请工伤认定：无论用人单位是填写第三方公司还是涉及实际工作单位，您都应及时向当地社会保险行政部门提出工伤认定申请，以确保自己的合法权益得到保障。
保留相关证据：在申请工伤认定过程中，您应保留好与工伤事故相关的所有证据，如医疗证明、工作记录、事故现场照片等，以便在需要时提供证明。
咨询专业律师：如果您在工伤认定申请过程中遇到任何疑问或困难，建议及时咨询专业律师，以获取更具体的法律建议和帮助。
希望以上分析能对您有所帮助。如果您在工伤认定申请过程中遇到任何问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。