结论：上级机关以夫妻双方需回避理由将一方跨区调动，这一行为的合法性需结合具体情况判断，若符合法定回避事由且程序合法，则可能是合法的；若不符合法定事由或程序违法，则可能不合法。以下从不同角度详细分析：
一、法定回避事由的考量
回避的法定情形：
- 根据《公务员法》及相关规定，公务员之间有夫妻关系、直系血亲关系、三代以内旁系血亲关系以及近姻亲关系的，不得在同一机关双方直接隶属于同一领导人员的职位或者有直接上下级领导关系的职位工作，也不得在其中一方担任领导职务的机关从事组织、人事、纪检、监察、审计和财务工作。
- 若夫妻双方在同一单位或存在直接上下级关系，且涉及上述需要回避的职位，那么上级机关基于回避原则进行调动是合法的。
跨区调动的合理性：
- 跨区调动本身并不直接决定合法性，关键在于调动是否基于合理的回避事由。如果调动是为了避免夫妻双方在同一单位或存在直接利益冲突的职位上工作，从而确保公务的公正性和效率，那么这种调动是合理的。
- 然而，如果调动并非基于回避原则，而是出于其他不正当目的（如打击报复、个人偏好等），则可能构成违法调动。
二、程序合法性的审查
调动程序的合规性：
- 任何调动都应遵循法定的程序，包括但不限于通知、听取意见、审批等环节。如果上级机关在调动过程中未遵循法定程序，如未提前通知、未听取被调动方的意见或未经合法审批，则可能构成程序违法。
- 程序合法性是判断调动合法性的重要方面，即使调动基于合理的回避事由，如果程序违法，也可能影响调动的合法性。
被调动方的权益保障：
- 在调动过程中，应充分保障被调动方的合法权益，如知情权、申诉权等。如果上级机关在调动过程中侵犯了被调动方的合法权益，如未告知调动理由、未提供申诉渠道等，则可能构成违法调动。
三、实际案例与司法实践
- 在司法实践中，对于因回避原则进行的调动，法院通常会审查调动是否基于合理的回避事由以及程序是否合法。如果调动符合法定回避事由且程序合法，法院通常会认定调动合法；反之，则可能认定调动违法。
- 例如，某案例中，夫妻双方在同一单位工作且存在直接上下级关系，上级机关基于回避原则将一方跨区调动。法院在审理时认为，调动基于合理的回避事由且程序合法，因此认定调动合法。
四、建议与措施
对于被调动方：
- 如果认为调动不合法或侵犯了自己的合法权益，可以向上级机关提出申诉或向相关部门反映情况。
- 必要时，可以寻求法律援助或咨询专业律师，以维护自己的合法权益。
对于上级机关：
- 在进行调动时，应确保调动基于合理的回避事由且程序合法。
- 应充分保障被调动方的合法权益，如提前通知、听取意见、提供申诉渠道等。
最后，如果您或您身边的人遇到类似问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供更详细的法律建议。