高层新房三楼改下水是否合法，需分情况讨论，主要取决于是否经过合法审批以及是否影响其他业主权益。以下从不同角度为你详细分析：

一、合法性判断的关键因素

1. 是否经过审批：

   • 合法情形：如果业主在改造下水管道前，已经向相关部门（如物业、城建部门等）提出了申请，并获得了批准，同时按照批准的方案进行施工，那么这种改造行为是合法的。
   • 非法情形：若业主未经审批，擅自改造下水管道，这可能违反了相关的建筑法规或物业管理规定，属于违法行为。

2. 是否影响其他业主权益：

   • 合法情形：改造行为未对其他业主的正常使用造成影响，比如未破坏公共设施、未导致下水堵塞或反水等问题，且改造后的下水管道符合安全标准，那么这种改造行为在不影响他人的前提下，可以认为是合法的。
   • 非法情形：如果改造行为导致其他业主的下水管道受损、堵塞或反水，影响了其他业主的正常使用，那么这种改造行为就是违法的，受损业主有权要求恢复原状或赔偿损失。

二、可能涉及的法律后果

1. 行政处罚：

   • 如果业主未经审批擅自改造下水管道，且被相关部门查处，可能会面临行政处罚，如罚款、责令恢复原状等。

2. 民事赔偿：

   • 如果改造行为导致其他业主受损，受损业主有权要求改造业主承担民事赔偿责任，包括修复费用、赔偿损失等。

3. 刑事责任（极端情况）：

   • 在极端情况下，如果改造行为严重违反了建筑安全规定，导致重大安全事故，改造业主还可能承担刑事责任。

三、建议与措施

1. 提前审批：

   • 在进行下水管道改造前，务必向相关部门提出申请，并获得批准。这不仅可以确保改造行为的合法性，还可以避免后续可能出现的纠纷和损失。

2. 咨询专业意见：

   • 在进行改造前，最好咨询专业的装修公司或工程师的意见，确保改造方案的科学性和合理性。同时，也可以了解改造过程中可能遇到的问题和风险，以便提前做好应对措施。

3. 与邻居沟通：

   • 在进行改造前，最好与相邻业主进行沟通，了解他们的意见和需求。这有助于减少改造过程中可能出现的纠纷和矛盾，确保改造行为的顺利进行。

4. 保留证据：

   • 在进行改造过程中，务必保留好相关的证据和文件，如审批文件、施工合同、支付凭证等。这些证据在后续可能出现的纠纷中具有重要的证明作用。

总结来说，高层新房三楼改下水是否合法，取决于是否经过合法审批以及是否影响其他业主权益。在进行改造前，务必了解相关法律法规和规定，确保改造行为的合法性和合理性。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。