如果公司不认定农民工工伤，农民工可以通过以下途径来维护自己的合法权益：

1. 申请工伤认定：

   • 根据《工伤保险条例》的相关规定，职工发生事故伤害或者按照职业病防治法规定被诊断、鉴定为职业病，所在单位应当自事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起30日内，向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。
   • 如果公司未在规定时间内提出工伤认定申请，农民工或者其近亲属、工会组织在事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起1年内，可以直接向用人单位所在地统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。

2. 收集并保存证据：

   • 农民工应尽可能收集与工伤相关的证据，如医疗记录、事故现场照片、证人证言等，以证明工伤事实的存在。
   • 这些证据在后续的工伤认定、劳动能力鉴定以及可能的法律诉讼中都将起到关键作用。

3. 寻求法律援助或咨询：

   • 如果农民工对工伤认定流程或相关法律法规不熟悉，可以寻求法律援助或咨询专业律师（比如我，擅长多领域法律实务，有问题可以直接向我咨询），以获取专业的指导和帮助。
   • 律师可以协助农民工准备工伤认定申请材料，提供法律意见，并在必要时代表农民工参与法律诉讼。

4. 申请劳动仲裁或提起诉讼：

   • 如果公司拒绝认定工伤且社会保险行政部门也未作出工伤认定决定，农民工可以向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，要求公司承担工伤赔偿责任。
   • 如果对劳动仲裁结果不满，农民工还可以向人民法院提起诉讼，通过司法途径来维护自己的合法权益。

5. 关注工伤赔偿项目：

   • 在工伤认定后，农民工应关注自己应享有的工伤赔偿项目，如医疗费、停工留薪期工资、护理费、一次性伤残补助金等。
   • 如果公司未依法支付工伤赔偿，农民工可以通过法律途径来追讨。