结论前置：签了工伤赔偿协议后，一般情况下不能再申请仲裁，因为协议具有法律效力。但在特定情况下，如存在重大误解、显失公平或用人单位欺诈、胁迫、乘人之危等，劳动者仍可以申请仲裁，请求撤销或变更协议。以下是对此问题的详细分析：
一、协议有效且履行完毕的情况
如果双方签订的工伤赔偿协议是在平等自愿的基础上达成的，内容不违反法律法规的强制性规定，且已经实际履行完毕，那么该协议通常具有法律效力。在这种情况下，劳动者一般不能再就同一事项申请劳动仲裁或提起诉讼。例如，劳动者因工伤导致一定程度的伤残，与用人单位经过协商，签订了赔偿协议，并已经按照协议获得了相应的赔偿，此时劳动者再申请仲裁，可能无法得到支持。
二、协议存在法定无效或可撤销情形的情况
显失公平：
- 如果赔偿协议的内容明显对劳动者不利，如赔偿金额远低于法定标准，导致双方权利义务不对等，劳动者可以主张协议显失公平，并请求撤销该协议。例如，劳动者因工伤导致严重伤残，但协议中约定的赔偿金额远低于按照《工伤保险条例》计算出的应得金额，这种情况下，劳动者有权申请劳动仲裁或提起诉讼，要求撤销协议并按照法定标准获得赔偿。
重大误解：
- 劳动者在签订协议时，如果对工伤的严重程度、赔偿项目、金额等重要内容存在错误认识，且这种误解对其造成了较大损失，可以认为存在重大误解。例如，劳动者因缺乏专业知识，误以为自己的伤势不重，从而接受了较低的赔偿金额，但实际上伤势远比想象中严重，此时劳动者可以申请仲裁，请求撤销或变更协议。
欺诈、胁迫或乘人之危：
- 如果用人单位在与劳动者签订赔偿协议时存在欺诈、胁迫或乘人之危的行为，如隐瞒工伤事实、威胁劳动者不签协议就不支付工资等，劳动者也可以主张协议无效或可撤销。在这种情况下，劳动者同样可以申请劳动仲裁或提起诉讼，要求确认协议无效或撤销协议，并重新确定赔偿数额。
违反法律法规的强制性规定：
- 如果赔偿协议的内容违反了法律法规的强制性规定，如约定用人单位不承担工伤保险责任，则该协议也将被认定为无效。劳动者可以依据相关法律法规的规定，申请劳动仲裁或提起诉讼，要求确认协议无效并获得相应的赔偿。
三、申请劳动仲裁的时效与注意事项
时效问题：
- 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的相关规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。因此，劳动者在发现赔偿协议存在问题后，应及时在规定的时效期间内申请劳动仲裁。
证据准备：
- 在申请劳动仲裁前，劳动者应尽可能收集相关证据，如赔偿协议、医疗证明、工资单、沟通记录等，以证明协议存在重大误解、显失公平或用人单位存在不正当手段。这些证据将有助于支持劳动者的主张，提高仲裁成功的可能性。
法律程序：
- 劳动者需要向劳动争议仲裁委员会提交书面仲裁申请，并按照要求提供相关证据材料。仲裁委员会将依法受理申请，并组织双方进行调解或开庭审理。劳动者应遵守仲裁庭的程序规定，积极配合仲裁庭的调查和审理工作。
总结与建议：虽然签订工伤赔偿协议后一般不能再申请仲裁，但在特定情况下，劳动者仍有权申请仲裁以维护自身权益。因此，在签订协议前务必谨慎考虑，并尽可能了解相关法律法规和赔偿标准。如果发现协议存在问题或自身权益受到侵害，应及时咨询专业律师（即我本人，杨翠菊律师，专注于劳动纠纷、工伤赔偿领域）并申请劳动仲裁。