三个以上执法部门联合检查，只有两个部门各派一名执法人员参加，这种做法是否合法，需分情况讨论：

1. 从联合检查的法定要求来看：

   • 联合检查通常要求多个执法部门共同参与，以确保检查的全面性和公正性。然而，法律并未明确规定每次联合检查必须每个部门都派出相同数量的执法人员，或者必须每个部门都参与每一次具体的检查行动。
   • 关键在于检查行动是否符合法定程序，以及是否能够达到检查的目的。如果两个部门派出的执法人员具备相应的执法资格，且能够按照法定程序完成检查任务，那么这种做法在形式上并不违反法律规定。

2. 从执法实践的角度来看：

   • 在实际操作中，由于各执法部门的工作重点、人员配置和资源分配等存在差异，因此可能无法每次都保证每个部门都派出执法人员参与联合检查。
   • 只要参与检查的执法人员具备相应的执法权限和资格，且检查行动得到了相关部门的授权和批准，那么这种做法在实践中是可行的。但需要注意的是，如果检查行动涉及多个部门的职责范围，且需要各部门共同协作才能完成，那么仅有两个部门参与可能会影响检查的效果和公正性。

3. 从潜在的法律风险来看：

   • 如果联合检查行动因为参与部门不足或执法人员数量不够而导致检查不全面、不公正，或者未能及时发现和处理违法行为，那么相关执法部门可能会面临法律责任。
   • 此外，如果检查行动违反了法定程序或超越了执法权限，那么参与检查的执法人员也可能会面临法律追究。

建议：

• 在进行联合检查时，各执法部门应尽可能协调一致，确保检查行动的全面性和公正性。如果确实无法保证每个部门都派出执法人员参与，那么应至少确保参与检查的执法人员具备相应的执法资格和权限，且能够按照法定程序完成检查任务。
• 同时，各执法部门应加强沟通和协作，共同制定检查计划和方案，明确各自的职责和任务，以确保检查行动的有效性和合法性。

后续行动：

• 如果您对联合检查的具体程序或要求有疑问，或者遇到了相关的法律问题，可以直接向我咨询。我会根据您的具体情况和需求，提供详细的法律解释和建议。