同一行政案件在一般情况下不能两次立案，但存在特定情形下的例外。以下是对此问题的详细分析：
一、一般原则：同一行政案件不应重复立案
“一事不再理”原则：
- 在行政诉讼中，遵循“一事不再理”原则。即对于已经经过法院实体审理并作出判决的行政案件，当事人不得就同一事实、同一诉讼标的、同一请求再次向法院提起诉讼。这一原则旨在维护司法裁判的权威性和稳定性，避免重复劳动和节约司法资源。
立案的唯一性：
- 行政案件一旦由某个法院立案受理，其他法院通常不会再次对该案件进行立案。这是为了确保案件的集中审理和高效处理，防止因重复立案而引发的管辖权争议和程序混乱。
二、特定情形下的例外
新证据或新事实的出现：
- 如果在原行政案件审结后，发现了与原案件相关的新证据或新事实，且这些新证据或新事实足以影响原案件的裁判结果，那么当事人可以申请再审或另行起诉。例如，在原行政处罚案件中，如果事后发现了新的证据证明处罚决定存在错误，当事人可以依法申请再审或提起新的行政诉讼。
行政行为的变更：
- 如果原行政行为生效后发生了变更，如行政机关自行撤销或改变了原行政行为，当事人对变更后的行政行为不服的，可以提起新的行政诉讼。这种情况下，虽然看似是对同一案件的再次处理，但实际上是对新行政行为的诉讼，因此不构成重复立案。
管辖权冲突或调整：
- 在某些复杂案件中，可能涉及多个法院的管辖权限。如果因管辖权冲突或调整导致案件需要由另一个法院重新立案审理，那么这种情况下的“两次立案”实际上是不同法院在各自职责范围内对案件的分工协作，不违反“一事不再理”原则。
三、实际应用与建议
判断重复立案的标准：
- 在实际应用中，判断某一行政案件是否属于重复立案，需要综合考虑案件的具体事实、法律依据以及诉讼程序的相关规定。如果案件已经经过法院实体审理并作出判决，且没有新证据或新事实的出现，那么再次立案通常会被视为重复立案。
维护自身合法权益的建议：
- 如果当事人认为自己的行政案件被重复立案或存在其他程序问题，可以及时向法院提出异议或申请再审。同时，建议当事人在提起行政诉讼前，充分了解相关法律法规和诉讼程序，确保自己的诉讼请求合法、合理且具有可诉性。
咨询专业律师的重要性：
- 行政诉讼涉及复杂的法律问题和程序规定，因此当事人在遇到相关问题时，建议直接向我咨询。我可以根据案件的具体情况，提供专业的法律意见和有效的解决方案，帮助当事人更好地维护自身的合法权益。
综上所述，同一行政案件在一般情况下不能两次立案，但存在特定情形下的例外。当事人在遇到相关问题时，应充分了解相关法律法规和诉讼程序，并在必要时寻求专业律师的帮助。