公司从农户处采购商品进行售卖，若没有合格证，确实可能会面临处罚，这主要基于以下几个方面的法律考量：

1. 产品质量责任：

   • 根据《中华人民共和国产品质量法》的相关规定，产品或者其包装上的标识必须真实，并符合下列要求：……（四）限期使用的产品，应当在显著位置清晰地标明生产日期和安全使用期或者失效日期；（五）使用不当，容易造成产品本身损坏或者可能危及人身、财产安全的产品，应当有警示标志或者中文警示说明。虽然该法条并未直接提及“合格证”，但合格证通常是产品符合质量标准、可以安全使用的证明，是产品质量责任的重要组成部分。
   • 若产品没有合格证，可能被视为产品标识不全或不符合规定，从而构成违法行为，相关部门有权依法进行处罚。

2. 消费者权益保护：

   • 消费者在购买商品时，有权了解商品的真实情况，包括商品的质量、性能、用途、有效期限等信息。合格证是消费者了解商品质量状况的重要途径之一。
   • 若公司售卖的商品没有合格证，可能侵犯了消费者的知情权，消费者有权向相关部门投诉，相关部门在查实后，可能会对公司进行处罚。

3. 行政处罚的可能性：

   • 具体处罚措施可能因地区、行业及违法情节的严重程度而有所不同，但通常包括警告、罚款、没收违法所得、责令停业整顿等。
   • 在某些情况下，如果公司的行为构成犯罪（如生产、销售伪劣产品罪），还可能面临刑事处罚。

针对这一情况，我给出以下建议：

• 立即整改：公司应立即停止销售没有合格证的商品，并尽快与农户沟通，要求提供合格证或进行质量检测，确保商品符合质量标准。
• 完善采购流程：在未来的采购过程中，公司应建立严格的采购审核机制，确保所采购的商品都有合格证或其他质量证明文件。
• 加强法律意识：公司应加强对相关法律法规的学习和了解，提高法律意识，避免因违法行为而面临处罚。

若公司已经因此受到处罚或面临处罚风险，我建议：

• 积极配合调查：公司应积极配合相关部门的调查工作，如实提供相关信息和证据。
• 寻求法律帮助：如有必要，公司可以寻求专业律师的帮助，了解自身权益和义务，制定合理的应对策略。

总之，公司从农户处采购商品进行售卖时，必须确保商品有合格证或其他质量证明文件，以避免因违法行为而面临处罚。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。