结论：公司注销后，员工一般不可以直接起诉公司股东要求赔偿未缴纳公积金的损失，但在特定情况下，如股东存在滥用权利等情形，员工可能有机会通过法律途径追究股东责任。以下从不同角度进行分析：
一般情况：公司注销后员工难以直接起诉股东
- 公司独立人格与责任承担
- 根据公司法的基本原理，公司具有独立的法人资格，以其全部财产对公司的债务承担责任。公积金的缴纳义务主体是公司，当公司正常存续时，若未为员工缴纳公积金，员工可以通过向住房公积金管理中心投诉等途径要求公司补缴。
- 当公司注销后，其法人资格终止，从法律上来说，公司的债务（包括可能因未缴纳公积金而产生的责任）原则上随着公司的注销而消灭。因为公司注销意味着其作为一个法律主体的消亡，不再具有承担民事责任的能力和资格，所以员工一般不能直接起诉公司股东要求赔偿未缴纳公积金的损失。
- 股东有限责任原则
- 股东以其出资额为限对公司承担责任。在公司正常经营和清算过程中，股东履行了出资义务后，对于公司的债务，除非存在特殊情况，一般不再承担额外的责任。在公司注销的情况下，只要股东按照法定程序完成了清算义务，没有侵占公司财产等违法行为，对于公司未缴纳公积金给员工造成的损失，股东通常不需要承担赔偿责任。
特殊情况：股东可能承担责任的情形
- 股东未依法清算
- 如果股东在公司注销过程中，未按照法定程序进行清算，例如未通知债权人申报债权、虚假清算等，导致员工无法在公司注销前主张未缴纳公积金的权益，那么股东可能需要承担相应的赔偿责任。
- 根据相关法律规定，有限责任公司的股东、股份有限公司的董事和控股股东未在法定期限内成立清算组开始清算，导致公司财产贬值、流失、毁损或者灭失，债权人主张其在造成损失范围内对公司债务承担赔偿责任的，人民法院应依法予以支持。在这种情况下，员工可以视为公司的债权人，要求股东在造成损失的范围内承担赔偿责任。
- 股东滥用公司法人独立地位和股东有限责任
- 若股东存在滥用公司法人独立地位和股东有限责任，逃避债务，严重损害公司债权人利益的行为，例如股东将公司财产与个人财产混同、过度支配与控制公司等，员工可以突破股东的有限责任，要求股东对公司债务承担连带责任。
- 在未缴纳公积金的情况下，如果股东的上述行为导致公司无法履行缴纳公积金的义务，给员工造成了损失，员工可以通过法律途径追究股东的连带责任。
法律建议
- 收集证据
- 员工应尽可能收集能够证明公司未缴纳公积金的证据，如工资条、劳动合同、工作证明等，这些证据可以证明员工与公司之间存在劳动关系以及公司未履行缴纳公积金的义务。
- 咨询专业律师
- 由于涉及公司注销、股东责任等复杂的法律问题，员工可以向我咨询，我会根据具体情况分析股东是否存在需要承担责任的情形，并为员工提供相应的法律建议和维权方案。
- 尝试其他途径解决
- 在考虑起诉股东之前，员工也可以尝试与股东进行协商，看是否能够通过协商的方式解决未缴纳公积金的问题。如果协商无果，再考虑通过法律途径维护自己的权益。
总之，公司注销后员工能否起诉股东要求赔偿未缴纳公积金的损失，需要根据具体情况进行判断。如果员工遇到此类问题，建议及时寻求专业法律帮助。