本村人购买房子仅有转让协议和见证书，不一定完全合法，需分情况讨论：
若房子属于合法建筑且转让行为符合规定
- 转让协议效力：如果转让的房子是合法建造的，拥有合法的产权证明（如宅基地使用证、房屋所有权证等），并且转让行为符合法律法规关于农村房屋买卖的规定（例如，符合“房地一体”原则，即房屋转让时宅基地使用权随之转让，且受让人符合宅基地使用权取得的条件，一般是本集体经济组织成员等）。在这种情况下，转让协议是双方真实意思表示，内容合法，不违反法律法规的强制性规定和公序良俗，那么转让协议是有效的。
- 见证书作用：见证书通常是由一定的组织或个人对转让协议的签订过程进行见证并出具的书面材料。虽然见证书本身并不直接赋予转让行为合法性，但它可以在一定程度上证明转让协议是双方自愿签订的，在后续可能出现的纠纷中，作为证明协议签订情况的一种证据。不过，见证书的效力取决于见证人的资质和见证过程的合法性等因素。如果见证人是具有合法资质的机构或人员，且见证过程符合相关规定，那么见证书具有一定的证明力；反之，如果见证人没有相应资质或者见证过程存在瑕疵，见证书的证明力可能会受到影响。
- 整体合法性：综合来看，在这种情况下，有合法的转让协议和具有一定证明力的见证书，该房屋转让行为一般是合法的。
若房子属于违法建筑或转让行为不符合规定
- 转让协议效力：如果房子是违法建筑，例如未经批准擅自建造的房屋，或者转让行为违反了法律法规的强制性规定（如将房屋转让给非本集体经济组织成员，且不符合特定条件；或者违反了“一户一宅”原则等）。在这种情况下，转让协议可能会因为违反法律法规的强制性规定而被认定为无效。因为法律对于违法建筑的处置有明确规定，不允许通过买卖等方式进行合法流转，以维护土地管理秩序和公共利益。
- 见证书作用：即使有见证书，由于转让协议本身无效，见证书也无法改变这一事实。见证书只能证明协议签订的过程，但不能使违法的转让行为变得合法。
- 整体合法性：所以，在这种情况下，仅有转让协议和见证书，该房屋转让行为是不合法的。
建议：在进行农村房屋买卖时，一定要确保房屋的合法性以及转让行为的合规性。在签订转让协议前，最好咨询专业的法律人士或者相关部门，了解具体的法律法规和政策要求，避免后续出现纠纷和损失。如果你有关于农村房屋买卖等法律问题，都可以直接向我咨询。