转让农村宅基地协议书的合法性需视具体情况而定。以下从不同角度为您详细分析：
一、合法转让的情况
同一集体经济组织成员间转让：
- 根据《中华人民共和国民法典》及《中华人民共和国土地管理法》的相关规定，农村宅基地的所有权归农民集体所有，个人仅享有使用权。在同一集体经济组织成员之间，如果转让人拥有二处以上的农村住房（含宅基地），且受让人没有住房和宅基地，同时符合宅基地使用权分配条件，转让行为征得集体组织同意，那么这种转让协议通常是合法的，并受到法律保护。
符合法定条件的转让：
- 转让行为必须同时满足以下条件：转让人拥有二处以上的宅基地；转让人与受让人为同一集体经济组织内部的成员；受让人没有住房和宅基地，且符合宅基地使用权分配条件；转让行为征得集体经济组织同意。这些条件应同时具备，转让协议才可能被认定为合法。
二、非法转让的情况
向非本集体经济组织成员转让：
- 如果宅基地转让协议涉及向非本集体经济组织成员转让，那么这种转让行为是违法的，转让协议无效。因为农村宅基地属于集体所有，个人只有使用权，没有所有权，不能随意向集体外成员转让。
未经过集体组织同意的转让：
- 即使转让人和受让人都是同一集体经济组织的成员，但如果转让行为未经过集体组织同意，那么这种转让协议也可能被认定为无效。因为宅基地的转让涉及到集体组织的利益，必须征得集体组织的同意。
城镇居民购买农村宅基地：
- 城镇居民购买农村宅基地及其地上房屋的转让协议一律无效。因为农村宅基地的使用权仅限于本集体经济组织的成员，城镇居民不具备购买资格。
三、法律后果与建议
- 法律后果：非法转让农村宅基地协议书可能导致转让行为无效，双方可能面临法律责任，如返还财产、赔偿损失等。
- 建议：
- 在进行农村宅基地转让时，务必确保转让行为符合法律法规的规定，征得集体组织的同意，并签订合法有效的转让协议。
- 如果对转让协议的合法性存在疑问，建议咨询专业律师进行法律审查，以确保转让行为的合法性和有效性。
总结来说，转让农村宅基地协议书的合法性取决于多种因素，包括转让双方的身份、转让条件是否满足以及是否经过集体组织的同意等。在进行农村宅基地转让时，请务必谨慎对待，确保转让行为的合法性和有效性。如果您有任何法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。