结论：协议解除劳动关系若员工不同意不签字，公司是否继续发工资需分情况讨论，主要取决于双方劳动关系的实际状态及公司行为是否合法。

分析如下：

1. 若公司单方面违法解除劳动关系：

   • 根据《劳动合同法》的相关规定，公司单方面违法解除劳动关系，员工有权要求公司继续履行劳动合同，或者要求公司支付违法解除劳动关系的赔偿金。
   • 在此情况下，若员工选择要求继续履行劳动合同，且实际上公司也未完全停止员工的工作（如未收回工作证、未停止工作安排等），则公司应当继续支付工资，直至劳动合同实际解除或法院判决解除之日。
   • 若员工选择要求支付赔偿金，则公司无需再支付工资，但需支付相应的赔偿金。

2. 若公司未实际解除劳动关系，仍安排员工工作：

   • 即使员工不同意解除劳动关系的协议并拒绝签字，但只要公司未实际采取解除劳动关系的措施（如未办理离职手续、未停止工作安排等），且员工仍继续为公司提供劳动，则公司应当继续支付工资。

3. 若公司已实际解除劳动关系，且解除行为合法：

   • 若公司已按照法定程序（如提前通知、支付经济补偿等）解除了与员工的劳动关系，且员工也未提出异议或申请劳动仲裁，则公司无需再支付工资。
   • 但若员工认为公司的解除行为违法，并申请了劳动仲裁或提起了诉讼，且仲裁或诉讼结果尚未确定，则在此期间，若员工仍继续为公司提供劳动（如公司未收回工作证、未停止工作安排等），公司应当支付工资；若员工未提供劳动，则公司无需支付工资，但需根据仲裁或诉讼结果承担相应的法律责任。

法律建议：

• 对于员工而言，若不同意公司提出的解除劳动关系的协议，应明确表达自己的意愿，并保留好相关证据（如工作证、工作安排记录、工资支付记录等），以备后续维权之需。
• 若公司已实际停止了员工的工作并办理了离职手续，但员工认为公司的解除行为违法，应及时向劳动仲裁机构申请劳动仲裁或向法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。
• 对于公司而言，在解除劳动关系时，应确保解除行为的合法性，并按照法定程序进行操作，以避免不必要的法律纠纷和损失。

可能后果：

• 若公司违法解除劳动关系且未支付工资，员工有权要求公司支付拖欠的工资及相应的经济补偿或赔偿金。
• 若员工在劳动关系存续期间未提供劳动且无正当理由，公司有权不支付工资，并可能根据规章制度对员工进行处理。