公务员在被刑事拘留后，若最终不起诉，其工资待遇在特定期间内会停发，但后续会恢复并补发。以下是对此问题的详细分析：

一、法律依据与规定

1. 《中华人民共和国公务员法》及相关规定：

   • 公务员在受处分期间（包括因涉嫌犯罪被采取强制措施期间）不得晋升职务和级别。虽然该法未直接提及停发工资，但结合公务员管理的整体原则和后续规定，可以理解为在特定情形下（如涉嫌犯罪被拘留），公务员的工资待遇可能会受到影响。
   • 公务员被取保候审、监视居住、刑事拘留、逮捕期间，停发工资待遇，按本人原基本工资的75%计发生活费，不计算工作年限。这一规定明确了在公务员因涉嫌犯罪被采取强制措施期间，其工资待遇的具体处理方式。

2. 《关于公务员被采取强制措施和受行政刑事处罚工资待遇处理有关问题的通知》：

   • 该通知进一步细化了公务员在特定情况下的工资待遇处理方式，包括刑事拘留、逮捕等强制措施期间的工资停发及后续恢复的规定。

二、停发工资的原因与目的

1. 原因：

   • 公务员作为国家机关的公职人员，其行为应当符合法律法规和职业道德的要求。当公务员因涉嫌犯罪被采取强制措施时，其行为已经触犯了法律的红线，因此有必要对其工资待遇进行调整。

2. 目的：

   • 停发工资并非对公务员的惩罚性措施，而是基于其涉嫌犯罪的事实和公务员管理的需要而作出的临时性调整。同时，通过停发工资也可以促使公务员更加珍惜自己的职业身份和荣誉，遵守法律法规和职业道德规范。

三、最终不起诉后的工资待遇恢复

1. 恢复条件：

   • 如果经审查核实，公安机关撤销案件、人民检察院不起诉或人民法院宣告无罪、免予刑事处罚，且公务员未受到其他相关处分（如收容教育、强制隔离戒毒、劳动教养、行政拘留），则恢复工资待遇。

2. 补发工资：

   • 恢复工资待遇的同时，会补发停发期间的工资，且被采取强制措施期间计入工作年限。这体现了法律对公务员合法权益的保护，也是对错误处理的纠正机制。

四、具体案例与说明

假设某公务员因涉嫌犯罪被刑事拘留，期间停发了工资待遇。后经人民检察院审查，决定不起诉。此时，该公务员的工资待遇应得到恢复，并补发停发期间的工资。同时，被采取强制措施期间应计入工作年限，不影响其未来的职务晋升和级别调整。

五、建议与注意事项

1. 了解法律规定：

   • 公务员应了解相关法律法规和政策规定，明确自己在被采取强制措施期间的权利和义务。

2. 保留证据：

   • 在处理此类事件时，公务员应保留好相关证据和文件，以便在后续恢复工资待遇和补发工资时提供证明。

3. 咨询专业律师：

   • 如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，公务员可以直接向我咨询，我将根据具体情况提供专业的法律意见和建议。

综上所述，公务员在被刑事拘留后若最终不起诉，其工资待遇在特定期间内会停发，但后续会恢复并补发。这是基于法律法规的规定和公务员管理的需要而作出的合理安排。