加班费和交通补贴是否算作工资的一部分，需分别进行分析，结论如下：
一、加班费
法律明确规定：根据《关于工资总额组成的规定》第四条，工资总额由计时工资、计件工资、奖金、津贴和补贴、加班加点工资以及特殊情况下支付的工资六个部分组成。其中明确包括了“加班加点工资”，因此，加班费在法律上被明确认定为工资的一部分。
实际影响：加班费作为工资的一部分，不仅影响劳动者的实际收入，还在计算社保缴纳基数、经济补偿金等方面发挥重要作用。例如，在计算经济补偿金时，加班费应计入工资总额，作为计算经济补偿金的基础。
二、交通补贴
交通补贴是否算作工资的一部分，则取决于其发放方式和目的：
算作工资一部分的情况：
- 发放方式：若交通补贴按月固定发放，具有稳定性和常规性特点。
- 关联因素：与劳动者的出勤、工作业绩等挂钩，体现对劳动者工作的补偿性质。
- 法规依据：根据《关于工资总额组成的规定》，工资总额包括津贴和补贴。交通补贴若符合津贴和补贴的特征（即为补偿职工特殊或额外的劳动消耗而支付），则应计入工资总额。
- 实际应用：在司法实践中，涉及经济补偿计算、加班工资计算等情况时，这部分交通补贴通常会被纳入工资基数。
不算作工资一部分的情况：
- 发放方式：若交通补贴并非按月固定发放，而是根据实际发生的交通费用进行实报实销。
- 本质属性：这种补贴本质上是对员工实际支出的一种费用补偿，不具有工资的稳定性、常规性和补偿劳动的属性。
- 福利措施：它被视为企业为员工提供的一项福利措施，用于减轻员工因工作产生的交通成本负担，而非作为劳动报酬的一部分。
综合建议
- 对于加班费：劳动者应明确其作为工资一部分的法律地位，确保在计算经济补偿、社保缴纳等时得到正确计入。
- 对于交通补贴：劳动者应了解其发放方式和目的，以判断其是否属于工资范畴。若按月固定发放且与工作相关联，则应视为工资的一部分；若为实报实销，则不属于工资范畴。
在实际操作中，若劳动者对加班费或交通补贴的归属有疑问，建议保留相关证据（如工资条、补贴发放记录等），以便在需要时维护自己的合法权益。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会为你提供专业的法律意见。