行政机关超期申请强制执行，一般不承担刑事责任，但可能面临行政责任或程序上的不利后果。以下从不同角度进行详细分析：
刑事责任角度：
- 刑事责任通常涉及犯罪行为，即违反刑法规定，应受刑罚处罚的行为。行政机关超期申请强制执行，并不直接构成犯罪行为。除非在超期申请的过程中，行政机关工作人员存在故意或重大过失，且该行为触犯了刑法中的相关规定（如滥用职权罪、玩忽职守罪等），才可能承担刑事责任。但这种情况较为罕见，且需要具体证据支持。
行政责任角度：
- 行政机关超期申请强制执行，可能违反了行政程序法或相关行政法规的规定。在这种情况下，行政机关或其工作人员可能面临行政责任，如被上级行政机关责令改正、通报批评、给予行政处分等。这些责任主要是基于行政机关内部管理或监督的需要，而非刑事责任。
程序上的不利后果角度：
- 行政机关超期申请强制执行，还可能面临程序上的不利后果。例如，根据《中华人民共和国行政强制法》的相关规定，行政机关申请人民法院强制执行前，应当催告当事人履行义务。如果行政机关未在法定期限内申请强制执行，或者未履行催告程序，人民法院可能不予受理或裁定不予执行。这将对行政机关实现其行政目的造成不利影响。
具体案例与法律解释：
- 假设某行政机关对某企业作出了行政处罚决定，要求该企业缴纳罚款。但该企业未在规定期限内履行义务，行政机关也未在法定期限内申请人民法院强制执行。在这种情况下，行政机关的超期申请可能导致人民法院不予受理或裁定不予执行，从而使得行政处罚决定无法得到有效执行。
- 根据《中华人民共和国行政强制法》第五十三条：“当事人在法定期限内不申请行政复议或者提起行政诉讼，又不履行行政决定的，没有行政强制执行权的行政机关可以自期限届满之日起三个月内，依照本章规定申请人民法院强制执行。”如果行政机关超过这个期限申请强制执行，就可能面临上述程序上的不利后果。
建议与措施：
- 行政机关应严格遵守法定程序，确保在法定期限内申请强制执行，并履行必要的催告程序。
- 如果行政机关确实因特殊原因无法在法定期限内申请强制执行，应及时与人民法院沟通，说明情况并寻求解决方案。
- 行政机关应加强对工作人员的培训和管理，提高其对行政程序法和相关行政法规的认识和执行能力。
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