公司违法解除劳动关系时，赔偿标准原则上应按照劳动合同约定的工资标准进行赔付，而非按照降薪后的工资标准赔付。具体分析如下：

1. 违法解除劳动关系的赔偿依据
   根据《劳动合同法》第四十八条、第八十七条规定，用人单位违法解除劳动合同的，应当依照经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。经济补偿的计算基数为劳动者在劳动合同解除前十二个月的平均工资（《劳动合同法》第四十七条）。此处的“平均工资”应理解为劳动合同约定的正常工资标准，而非用人单位单方降薪后的工资。

2. 降薪行为的合法性审查
   若用人单位在解除劳动合同前未经劳动者同意单方降薪，该行为本身可能构成违法。根据《劳动合同法》第三十五条，变更劳动合同（包括工资标准）需双方协商一致并书面确认。未经协商的降薪属于违法行为，不能作为赔偿计算的依据。

3. 特殊情形下的工资认定

   • 若降薪行为已通过劳动仲裁或诉讼程序被确认为违法，且劳动者未实际接受降薪（如通过银行流水、工资条等证据证明实际未发放降薪部分），则赔偿基数仍应按原合同工资计算。
     
   • 若劳动者实际接受了降薪（如签署了降薪协议或未提出异议），且降薪程序合法（如因经营困难经民主程序协商一致），则可能以降薪后的平均工资作为赔偿基数。但此情形需严格审查降薪的合法性，实践中用人单位举证难度较高。

4. 实务建议
   劳动者在主张赔偿时，应重点收集以下证据：

   • 劳动合同中约定的工资标准；
     
   • 降薪前后的工资发放记录（银行流水、工资条）；
     
   • 用人单位单方降薪的通知或证明；
     
   • 劳动者对降薪提出异议的证据（如书面异议、沟通记录）。
     

若用人单位主张以降薪后工资计算赔偿，需由其承担降薪合法性的举证责任，否则应承担不利后果。

总结：违法解除的赔偿基数原则上以劳动合同约定工资为准，除非用人单位能证明降薪行为完全合法且劳动者实际接受。具体案件需结合证据综合判断，建议劳动者在维权时咨询专业律师以制定针对性策略。