对于公务人员非法持有股份的处理，需根据具体违法情形和法律规定进行综合判断，通常涉及纪律处分、行政处罚甚至刑事追责。以下从不同法律维度展开分析：
1. 纪律处分层面：违反公务员廉洁纪律
根据《中华人民共和国公务员法》第五十九条及《中国共产党纪律处分条例》第九十四条，公务员不得从事或参与营利性活动，包括违规经商办企业、违规拥有非上市公司（企业）的股份或证券等行为。
- 处理方式：
- 若查实公务人员非法持有股份，首先由纪检监察机关依据《中国共产党纪律处分条例》或《中华人民共和国公职人员政务处分法》给予警告、记过、记大过、降级、撤职、开除等政务处分；
- 若同时违反党纪，还需给予党纪处分（如警告、严重警告、撤销党内职务等）。
- 典型案例：某公务员违规持有亲属公司股份并参与分红，被给予撤职处分，并追缴违法所得。
2. 行政处罚层面：违反市场监管法规
若公务人员通过虚假身份、代持等方式非法参与企业经营活动，可能同时违反《公司法》《市场主体登记管理条例》等规定。
- 处理方式：
- 市场监管部门可责令其限期退出股份，并处以罚款（如《市场主体登记管理条例》第四十六条规定，提交虚假材料取得登记的，可处5万-50万元罚款）；
- 若涉及国家工作人员利用职务便利为他人谋利并收受股份，可能构成受贿罪（需结合刑事追责分析）。
3. 刑事追责层面：构成犯罪的情形
若公务人员非法持有股份的行为符合以下情形，可能触犯刑法：
- 受贿罪（《刑法》第三百八十五条）：
若股份是他人为谋取不正当利益而给予的“财物”，且公务人员利用职务便利为对方谋利，则构成受贿罪。例如，某官员收受企业干股（未实际出资但享有分红权），价值达3万元以上，即达到受贿罪立案标准。
- 贪污罪（《刑法》第三百八十二条）：
若公务人员利用职务便利，通过虚假手段将公共财产转化为个人股份（如侵吞国有资产入股私营企业），则可能构成贪污罪。
- 非法经营同类营业罪（《刑法》第一百六十五条）：
国有公司、企业的董事、经理利用职务便利，自己经营或为他人经营与其所任职公司同类的营业，获取非法利益，数额巨大的，可处三年以下有期徒刑或拘役。
处理流程：
- 纪检监察机关立案调查，查实违法事实；
- 根据情节轻重，给予政务处分或党纪处分；
- 若涉嫌犯罪，移送检察机关审查起诉，由法院依法判决。
4. 特殊情形：退股后的责任追究
即使公务人员已退出股份，若退股行为本身是为了掩盖违法事实（如事发后紧急转让），仍可能被追究责任。例如，某官员在审计前将股份转让给亲属，但分红资金仍通过亲属账户流转，最终仍被认定为受贿。
建议：
若您或身边人涉及此类问题，需立即停止违法行为，主动向组织说明情况并退缴违法所得，以争取从轻处理。具体操作需结合案件细节（如股份来源、是否利用职务便利、违法所得金额等）进一步分析，可直接向我咨询具体方案。