核心结论：进度款已支付的工程量若需变更，需根据变更原因、合同约定及实际履行情况，通过协商、补充协议或法律途径解决。以下是具体分析：

1. 合同有明确变更条款时
   若施工合同中已约定工程量变更的处理方式（如变更程序、价款调整规则等），双方应按合同执行。例如：

   • 变更导致工程量增加的，发包方需按约定支付追加款项；
     
   • 变更导致工程量减少的，承包方应退还多收款项或抵扣后续工程款。
     关键点：合同条款是首要依据，需严格审查变更通知、确认单等书面文件是否符合约定。

2. 合同无明确约定或约定模糊时
   根据《民法典》第510条，双方可协商补充约定；协商不成的，按以下原则处理：

   • 变更原因：若因发包方设计错误、需求变更等导致工程量变化，发包方通常需承担合理费用；
     
   • 实际履行：若承包方已按原设计完成部分工程，发包方要求变更的，需赔偿承包方已购材料、设备及返工损失；
     
   • 公平原则：法院或仲裁机构可能根据实际投入、市场价等因素，酌情调整价款。
     关键点：保留变更前后的沟通记录、施工日志、材料采购凭证等证据，以证明实际损失。

3. 已支付进度款与变更的冲突处理

   • 若进度款已按原工程量支付，但后续需变更减少工程量，发包方有权要求承包方返还多付部分，或通过后续工程款抵扣；
     
   • 若变更增加工程量且未在进度款中体现，承包方可主张追加支付，但需提供变更签证、验收单等证明文件。
     关键点：及时办理变更签证，避免因未确认导致举证困难。

4. 争议解决途径
   若双方无法达成一致，可：

   • 依据合同仲裁条款申请仲裁；
     
   • 向法院提起诉讼，主张变更价款或赔偿损失。
     关键点：注意诉讼时效（通常为3年），并提前准备合同、变更文件、付款凭证等证据。

建议：

• 立即书面通知对方变更需求，明确变更内容、原因及价款调整方案；
  
• 协商过程中，要求对方签署变更确认单，避免口头约定；
  
• 若涉及重大变更，建议委托第三方造价机构评估费用，确保公平性。
  

如有进一步细节（如合同条款、变更原因等），可向我补充说明，我会为您分析具体风险点。