企业让科员包保是否合法，需根据具体情况判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
一、包保责任制的合法性基础
包保责任制本身并非法律术语，而是企业管理中的一种责任分配方式。其合法性取决于具体实施方式是否符合法律法规的规定，尤其是是否违反了劳动法、劳动合同法等相关法律对于劳动者权益的保护。
自愿原则：如果科员自愿承担包保责任，并且企业与科员之间就此达成了明确的协议，且该协议不违反法律法规的强制性规定，那么这种包保责任制在法律上可能是有效的。但企业不得强迫或变相强迫科员接受包保责任。
内容合法性：包保责任的内容必须合法，不能包含违法或侵犯劳动者权益的条款。例如，包保责任不能要求科员承担企业违法经营的责任，或者要求科员在非工作时间、非工作场所承担与工作无关的责任。
二、可能存在的法律风险
违反劳动法规定：如果包保责任制导致科员的工作时间、工作强度超出法定标准，或者侵犯了科员的休息权、健康权等合法权益，那么这种包保责任制可能违反劳动法的规定，科员有权拒绝并可以向劳动监察部门投诉。
责任转嫁风险：企业将本应由企业承担的责任转嫁给科员，可能构成责任转嫁的违法行为。特别是在涉及安全生产、环境保护等关键领域，企业不得将法定责任转嫁给个人。
三、具体建议
审查包保协议：如果企业要求科员签订包保协议，科员应仔细审查协议内容，确保协议不违反法律法规的强制性规定，并且不侵犯自己的合法权益。如有疑问，可以咨询专业律师。
拒绝非法要求：如果企业强迫或变相强迫科员接受非法的包保责任，科员有权拒绝，并可以向劳动监察部门投诉或寻求法律援助。
企业合规管理：企业应确保包保责任制的实施符合法律法规的规定，避免将法定责任转嫁给个人，同时保障科员的合法权益。企业可以制定合法的包保责任制度，并明确责任范围、责任期限、责任追究等事项。
举例说明：假设某企业要求科员签订包保协议，承诺在非工作时间也负责企业的安全生产工作。这种要求显然超出了科员的正常工作职责范围，且可能侵犯科员的休息权。在这种情况下，科员有权拒绝签订该协议，并可以向劳动监察部门投诉企业的违法行为。
总结来说，企业让科员包保是否合法，需根据包保责任制的具体实施方式、内容以及是否违反法律法规的强制性规定来判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。