关于公司一年进行三次体检是否合法的问题，这主要取决于体检的性质、目的以及是否符合相关法律法规的要求。以下是对此问题的详细解答：

首先，我们需要明确的是，体检本身并不违法，关键在于体检的频率、内容以及实施体检的主体是否符合法律法规的规定。对于公司组织的体检，通常可以分为职业健康检查和一般健康检查两类。

1. 职业健康检查：

   • 根据《中华人民共和国职业病防治法》等相关法律法规，用人单位应当按照职业病危害分类情况，委托有资质的职业卫生技术服务机构对工作场所进行职业病危害因素检测、评价，并对接触职业病危害的劳动者进行上岗前、在岗期间和离岗时的职业健康检查。
   • 对于职业危害严重的岗位，法律法规可能要求更频繁的体检，如每年一次的定期检测和三年一次的现状评价，但这并不意味着可以随意增加体检次数。体检的频率应当基于职业病危害的实际情况和法律法规的要求来确定。
   • 如果公司一年进行三次职业健康检查，且每次检查都是基于职业病危害的实际情况和法律法规的要求，那么这种做法是合法的。但如果体检频率过高，且没有合理的依据，则可能涉嫌违法或不合理。

2. 一般健康检查：

   • 对于一般健康检查，如年度体检等，法律法规并没有明确规定体检的频率。因此，公司一年进行三次一般健康检查并不直接违反法律法规。
   • 然而，如果公司频繁组织体检，且体检内容与工作无关或对员工造成不必要的负担，那么这种做法可能引发员工的不满或质疑。在这种情况下，公司应当考虑体检的合理性和必要性，以及员工的感受和需求。

3. 其他考虑因素：

   • 除了法律法规的要求外，公司组织体检还应当考虑员工的隐私权和自主权。体检应当基于员工的自愿原则，且体检结果应当保密处理。
   • 如果公司强制要求员工进行频繁的体检，且体检内容涉及个人隐私或敏感信息，那么这种做法可能侵犯员工的合法权益。

总结与建议：

• 公司一年进行三次体检是否合法，取决于体检的性质、目的以及是否符合相关法律法规的要求。
• 对于职业健康检查，公司应当按照法律法规的要求和职业病危害的实际情况来确定体检的频率。
• 对于一般健康检查，公司应当考虑体检的合理性和必要性，以及员工的感受和需求。
• 在任何情况下，公司都应当尊重员工的隐私权和自主权，确保体检的合法性和合理性。

如果您对公司组织的体检频率或内容有疑问或不满，建议您与公司的人力资源部门或相关负责人进行沟通，了解体检的具体目的和依据，并表达您的意见和需求。如果沟通无果或您认为公司的做法涉嫌违法或不合理，您可以向当地的劳动监察部门或相关机构进行投诉或举报。