国资委46号令（即《企业国有资产交易监督管理办法》）本身并不直接针对企业因停薪留职对员工自动离职处分的国企职工提供特定保障。该办法主要规范的是企业国有资产的交易行为，包括企业产权转让、企业增资以及企业资产转让等，旨在防止国有资产流失，确保国有资产交易的公开、公平、公正。

针对您提出的问题，我们可以从以下几个角度进行分析：

1. 停薪留职与自动离职的法律规定：

   • 停薪留职是特定历史时期的一种用工形式，通常涉及员工与企业的协商一致，并明确停薪留职的期限、待遇等事项。若停薪留职期满后，员工未按时返岗且未与企业达成新的协议，企业可能会依据内部规章制度或相关法律法规对员工进行处理。
   • 自动离职则通常指员工未经企业同意，擅自离开工作岗位的行为。对于自动离职的员工，企业有权依据内部规章制度或相关法律法规进行处分，包括但不限于解除劳动合同、扣发工资等。

2. 国资委46号令的适用范围：

   • 如前所述，国资委46号令主要规范的是企业国有资产的交易行为，并不直接涉及员工的劳动关系管理。因此，该办法并不直接为因停薪留职而自动离职的国企职工提供保障。

3. 国企职工的权益保障：

   • 国企职工的权益保障主要依据《中华人民共和国劳动法》、《中华人民共和国劳动合同法》等法律法规。这些法律法规规定了员工的劳动权益、劳动合同的签订与解除、工资支付、社会保险等事项。
   • 若国企职工因停薪留职而自动离职，并因此受到不公正的处分或待遇，可以依据相关法律法规向企业主张自己的权益。例如，若企业违法解除劳动合同，员工有权要求企业支付经济补偿金或赔偿金。

4. 具体建议：

   • 对于因停薪留职而自动离职的国企职工，建议首先与企业进行沟通协商，了解企业的处理意见和依据。
   • 若认为企业的处理不公正或违法，可以收集相关证据（如劳动合同、停薪留职协议、企业规章制度等），并向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
   • 在处理过程中，建议咨询专业律师的意见，以确保自己的权益得到充分保障。

总结来说，国资委46号令并不直接为因停薪留职而自动离职的国企职工提供保障。国企职工的权益保障主要依据相关劳动法律法规。若遇到不公正的处分或待遇，建议与企业沟通协商、收集证据并咨询专业律师的意见。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。