结论：原配知道小三存在20年，是否还能起诉，这主要取决于起诉的具体内容和法律依据。一般来说，如果涉及的是重婚罪，可能会受到诉讼时效的限制；如果涉及的是离婚损害赔偿或财产分割等问题，则可能不受此限制，但需考虑其他法律因素。以下是对此问题的详细分析：
一、关于重婚罪的起诉
法律定义与诉讼时效：
- 重婚罪是指有配偶而重婚的，或者明知他人有配偶而与之结婚的行为。
- 根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，重婚罪的诉讼时效通常为五年，从犯罪行为终了之日起计算。这意味着，如果原配在知道小三存在后的五年内没有提起诉讼，那么可能因超过诉讼时效而无法再追究其刑事责任。
特殊情况：
- 如果重婚行为持续存在，即原配与小三的非法同居关系一直未中断，那么诉讼时效可能从该关系终止之日起计算。但即便如此，也需考虑证据收集、法律程序等实际因素。
二、关于离婚损害赔偿与财产分割
离婚损害赔偿：
- 如果原配因小三的存在而遭受精神损害或财产损失，可以在离婚时或离婚后一定期限内（通常根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，为三年）向法院提起诉讼，要求赔偿。
- 这种情况下，诉讼时效的计算通常从原配知道或应当知道其权益受到侵害之日起计算。
财产分割：
- 在离婚过程中，如果小三的存在影响了夫妻共同财产的分割，原配可以在离婚诉讼中提出相关主张。
- 财产分割的原则通常是根据夫妻双方的贡献、过错程度等因素进行公平分配。如果小三的存在被认定为过错行为，可能会影响财产分割的结果。
三、其他法律因素
证据收集：
- 无论起诉何种内容，证据都是关键。原配需要收集足够的证据来证明小三的存在以及其对婚姻关系造成的损害。
- 证据可能包括聊天记录、照片、视频、证人证言等。
法律程序：
- 起诉需要遵循一定的法律程序，包括提交起诉状、参加庭审等。
- 原配需要了解并遵守相关法律规定，以确保诉讼的顺利进行。
四、建议与行动
咨询专业律师：
- 鉴于法律问题的复杂性和专业性，我建议原配在决定起诉前咨询专业律师，以获取更具体、更准确的法律建议。
收集证据：
- 在咨询律师的同时，原配应开始收集相关证据，以支持其诉讼请求。
考虑诉讼策略：
- 根据具体情况和律师的建议，原配可以制定合适的诉讼策略，以最大化地维护自己的合法权益。
最后，原配知道小三存在20年是否还能起诉，取决于起诉的具体内容和法律依据。如果涉及重婚罪，可能受到诉讼时效的限制；如果涉及离婚损害赔偿或财产分割等问题，则可能不受此限制，但需考虑其他法律因素。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。