针对员工自离的情况，用人单位需要采取一系列合理且合法的措施来保障自身权益并妥善处理后续事宜。以下是一些详细的建议：

首先，明确劳动合同和规章制度：

• 确保劳动合同中明确规定了员工离职的程序和要求，包括提前通知期限、工作交接流程等。
• 规章制度中应包含对员工自离行为的处理规定，如扣发工资、要求赔偿损失等，但需注意这些规定必须合法且合理。

其次，与员工进行沟通：

• 在发现员工自离后，用人单位应尽快与员工取得联系，了解其离职原因和具体情况。
• 尝试与员工协商，要求其按照合同约定和规章制度办理离职手续，包括提前通知、工作交接等。

接下来，处理工资和福利问题：

• 根据劳动合同和规章制度，如果员工未按照约定提前通知或未进行工作交接，用人单位可以按照规定扣发部分工资作为惩罚。但需注意，扣发工资的金额必须合理，且不得违反法律法规的最低工资标准。
• 及时足额支付员工应得的工资和福利，这是用人单位的法定义务，不得因员工自离而克扣。

然后，办理离职手续：

• 尽管员工自离，但用人单位仍需按照法律法规和合同约定，为其办理离职手续，包括出具解除或终止劳动合同的证明、办理档案和社会保险关系转移手续等。
• 如果员工未进行工作交接，用人单位可以要求其配合完成，或者根据实际情况采取其他措施来确保工作的连续性。

最后，保障自身权益并寻求法律救济：

• 如果员工自离给用人单位造成了经济损失，用人单位可以要求其承担赔偿责任。但需注意，用人单位必须保留好相关证据材料，证明员工的违法行为与企业的损失具有因果关系，且相关损失具有合理性、明确性。
• 如果员工拒绝配合办理离职手续或承担赔偿责任，用人单位可以通过法律途径来维护自身权益，如向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼。

综上所述，针对员工自离的情况，用人单位应明确劳动合同和规章制度、与员工进行沟通、处理工资和福利问题、办理离职手续，并在必要时保障自身权益并寻求法律救济。