结论：公司能否辞退有不正当关系的管理者和下属，需根据具体情况判断，主要看是否违反公司规章制度、是否构成严重违反劳动纪律或职业道德，以及是否对公司造成重大损害。以下从不同角度详细分析：

1. 从公司规章制度角度

   • 情况说明：如果公司有明确的规章制度，且该制度中明确规定了员工之间不得有不正当关系，或者将此类行为列为严重违反公司纪律的行为，并规定了相应的处罚措施，包括辞退，那么公司有权依据该制度辞退相关员工。
   • 法律依据：根据《劳动合同法》第三十九条，劳动者严重违反用人单位的规章制度的，用人单位可以解除劳动合同。
   • 建议：公司应确保规章制度合法有效，即经过民主程序制定、已向劳动者公示或告知，且内容不违反法律法规的强制性规定。

2. 从劳动纪律和职业道德角度

   • 情况说明：即使公司没有明确的规章制度禁止不正当关系，但如果管理者和下属的不正当关系严重违反了劳动纪律或职业道德，如造成了恶劣影响、破坏了公司的工作氛围或损害了公司的形象等，公司也可能有权辞退相关员工。
   • 法律依据：同样依据《劳动合同法》第三十九条，劳动者严重失职，营私舞弊，给用人单位造成重大损害的，或者劳动者有其他严重违反用人单位的规章制度的情形的，用人单位可以解除劳动合同。这里的“严重违反劳动纪律或职业道德”可以视为“其他严重违反用人单位的规章制度的情形”的一种。
   • 建议：公司应明确劳动纪律和职业道德的具体内容，并在员工入职时进行告知和培训，以便在需要时能够依据这些规定处理员工的不当行为。

3. 从实际损害角度

   • 情况说明：如果管理者和下属的不正当关系对公司造成了实际损害，如泄露公司机密、利用职务之便谋取私利等，公司不仅有权辞退相关员工，还可以要求其承担赔偿责任。
   • 法律依据：依据《劳动合同法》第三十九条，劳动者因故意或重大过失给用人单位造成损害的，用人单位可以解除劳动合同，并要求劳动者承担赔偿责任。
   • 建议：公司应建立完善的监督机制，及时发现并处理员工的不当行为，以防止对公司造成实际损害。

额外提醒：

• 在处理此类问题时，公司应确保程序合法，即按照法律法规和公司规章制度的规定进行调查、取证和处罚，避免侵犯员工的合法权益。
• 如果员工对公司的辞退决定不服，可以依法申请劳动仲裁或提起诉讼，维护自己的合法权益。

后续行动建议：

• 如果您是公司方，建议审查并完善公司规章制度，明确禁止不正当关系等不当行为，并规定相应的处罚措施。
• 如果您是员工方，且认为公司的辞退决定不合法或不合理，建议及时咨询专业律师，了解自己的权益和维权途径。

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