公司一般不能仅以员工之间存在不正当男女关系为由辞退员工，但具体情形需结合实际情况和公司规章制度来判断。以下从不同角度为你详细分析：
一、法律层面
一般情况下的保护：
- 根据《劳动合同法》的相关规定，用人单位解除劳动合同应当有合法、合理的理由，并且需要遵循法定程序。员工之间的不正当男女关系，并不直接构成用人单位可以解除劳动合同的法定理由。
- 除非这种关系严重违反了公司的规章制度，或者对公司的正常运营、工作秩序造成了严重影响，否则公司不能仅凭此理由辞退员工。
规章制度的重要性：
- 如果公司规章制度中明确规定了员工之间不得有不正当男女关系，并且这种关系被视为严重违反公司纪律的行为，那么公司可能依据规章制度辞退员工。
- 但需要注意的是，规章制度必须经过民主程序制定，并且已经向员工公示或告知，否则可能因程序不合法而无效。
特殊情况下的处理：
- 如果员工之间的不正当男女关系涉及到了性骚扰、职场欺凌等违法行为，或者对公司造成了重大损失或恶劣影响，公司可能依据相关法律法规或规章制度进行处理，包括辞退员工。
二、实际操作层面
调查与取证：
- 如果公司怀疑员工之间存在不正当男女关系，并且认为这种关系可能对公司造成不良影响，公司应当进行调查，并收集相关证据。
- 调查过程应当合法、公正，避免侵犯员工的隐私权和其他合法权益。
沟通与协商：
- 在决定辞退员工之前，公司应当与员工进行沟通，了解员工的想法和态度，并尝试通过协商解决问题。
- 如果员工能够认识到自己的错误，并愿意改正，公司可以考虑给予一定的宽限期或处罚措施，而不是直接辞退。
合法辞退的程序：
- 如果公司决定辞退员工，必须遵循法定程序，包括提前通知员工、支付经济补偿金（如果适用）、办理离职手续等。
- 如果公司未按照法定程序辞退员工，员工可能有权要求公司继续履行劳动合同或支付赔偿金。
三、建议与风险提示
对于公司：
- 建议公司在制定规章制度时，明确规定员工之间的行为准则和纪律要求，包括不得有不正当男女关系等。
- 在处理员工之间的不正当男女关系时，应当遵循合法、公正、合理的原则，避免侵犯员工的合法权益。
对于员工：
- 如果员工之间确实存在不正当男女关系，并且担心公司可能因此辞退自己，建议员工主动与公司沟通，说明情况并寻求解决方案。
- 如果员工认为公司的辞退决定不合法或不合理，可以依法维护自己的合法权益，包括申请劳动仲裁或提起诉讼等。
总结来说，公司不能仅凭员工之间存在不正当男女关系就辞退员工，除非这种关系严重违反了公司的规章制度或对公司的正常运营造成了严重影响。在实际操作中，公司应当遵循合法、公正、合理的原则处理此类问题，并确保处理过程符合法定程序。如果你有进一步的法律问题或需要更具体的法律建议，可以直接向我咨询。