针对您提出的“营运客车超员发生交通事故后，保险公司如何赔偿”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、交强险赔偿
交强险，即机动车交通事故责任强制保险，是车辆必须投保的保险。在营运客车超员发生交通事故的情况下，交强险的赔偿不受超员影响。只要车辆投保了交强险，保险公司就需在责任限额内，对交通事故中受害人（不包括本车人员和被保险人）的人身伤亡、财产损失进行赔偿。
二、商业险赔偿情况
商业险，如第三者责任险等，其赔偿则需依据具体的保险合同条款。
超载作为事故原因：如果超载是导致事故发生的重要原因，或者违反了保险合同中的安全装载规定，保险公司可能会根据合同约定实行一定比例的免赔。这意味着，在超载的情况下，保险公司可能不会全额赔偿。
超载非事故原因：如果超载并非事故发生的直接原因，且保险合同未明确将超载列为免赔情形，那么保险公司应按合同约定在保额范围内承担相应赔偿责任。
三、客运公司及驾驶员责任
除了保险公司，客运公司和驾驶员也可能需要承担赔偿责任。
客运公司责任：作为车辆的运营管理者，客运公司对乘客负有安全保障义务。如果事故是由于客运公司管理不善（如安排疲劳驾驶、车辆维护不到位）或超载是公司授意、默认行为导致的，那么客运公司需要承担相应的赔偿责任。
驾驶员责任：驾驶员如果存在违规驾驶行为（如超速、酒驾、违反交通信号），且这些行为与事故发生有因果关系，那么即使超载不是唯一原因，驾驶员也需要承担责任。如果驾驶员受雇于客运公司，在执行职务过程中发生事故，通常由客运公司承担侵权责任；但如果驾驶员存在故意或重大过失，客运公司在赔偿后可以向其追偿。如果驾驶员是车辆所有人且非受雇于客运公司，那么他需要直接对事故受害人承担赔偿责任。
四、其他可能的责任主体
如果事故的发生还涉及其他第三方原因（如对方车辆违规导致碰撞），那么对方车辆的所有人、驾驶人及其投保的保险公司也需要按事故责任比例承担相应赔偿责任。
五、赔偿范围与责任认定
赔偿范围通常包括医疗费、误工费、护理费、残疾赔偿金、死亡赔偿金、丧葬费、交通费、营养费、住院伙食补助费等为治疗和康复支出的合理费用，以及因误工减少的收入。责任认定则由公安机关交通管理部门根据现场勘验、检查、调查情况和检验、鉴定结论制作交通事故认定书，作为处理交通事故的证据。
六、法律依据与建议
在处理此类问题时，应严格依据《中华人民共和国民法典》、《中华人民共和国道路交通安全法》等相关法律法规及保险合同条款进行责任划分和赔偿判定。我建议您在事故发生后及时咨询专业律师，以确保自身权益得到充分保护。同时，也提醒广大营运客车驾驶员和客运公司，务必严格遵守交通法规，确保乘客安全，避免类似事故的发生。