违建认定相关的文件是可以申请信息公开的。

根据《中华人民共和国政府信息公开条例》的相关规定，公民、法人或者其他组织有权依法向行政机关申请获取政府信息。对于违建认定这类涉及公众利益、需要公众知晓和监督的信息，行政机关在职责范围内应当予以公开，或者应申请人的要求提供相关信息。

以您提供的参考信息为例，有用户就申请公开了《厦门市人民政府关于印发历史遗留违法占地违法建设认定标准及分类处置意见的通知》（厦府〔2014〕362号）这一文件，并且厦门市人民政府或相关区政府也根据申请进行了答复，提供了该文件的复印件或者告知了获取途径。

申请信息公开的具体流程通常如下：

1. 确定申请对象：明确您想要获取哪一级行政机关的违建认定相关信息。

2. 准备申请材料：一般需要填写政府信息公开申请表，明确所需信息的内容描述、获取方式等。

3. 提交申请：可以通过线上申请、邮寄、现场提交等方式将申请材料提交给行政机关。

4. 等待答复：行政机关在收到申请后，会在法定期限内进行审查并作出答复。答复可能包括提供所需信息、告知获取途径、说明不予公开的理由等。

5. 救济途径：如果您对行政机关的答复不满意，可以依法申请行政复议或者提起行政诉讼。

注意事项：

• 在申请信息公开时，请尽量明确所需信息的内容描述，以便行政机关能够准确、及时地提供信息。
• 如果行政机关拒绝提供信息或者未在法定期限内答复，您可以依法寻求救济途径，维护自己的合法权益。

综上所述，违建认定相关的文件是可以申请信息公开的，您只需按照规定的流程向相关行政机关提出申请即可。