针对您提出的“自来水公司吃空饷20万怎么处理”的问题，这是一个涉及公职人员纪律和财政资金管理的重要议题。以下是我根据相关案例和规定，为您提供的详细解答：

首先，需要明确的是，“吃空饷”行为严重违反了公职人员的职业道德和纪律要求，同时也损害了公共利益和政府形象。对于此类行为，必须依法依规进行严肃处理。

一、调查核实

一旦发现自来水公司存在“吃空饷”的情况，相关部门应立即启动调查程序。这包括查阅工资发放记录、考勤记录、人员编制等相关资料，与涉事人员进行谈话核实，以及走访相关知情人士等。通过全面深入的调查，确保事实清楚、证据确凿。

二、责任追究

1. 对涉事人员的处理：

   • 对于直接参与“吃空饷”的人员，如长期在编不在岗、拿着单位工资却干自己事儿的人员，应依法依规给予相应的党纪政纪处分，如开除党籍、公职等。
   • 对于纵容、默许或参与安排亲属“吃空饷”的领导干部，更应从严处理，以儆效尤。

2. 对管理责任的处理：

   • 如果“吃空饷”问题的发生与单位管理不善、监督不力有关，那么相关管理人员也应承担相应的责任。这可能包括给予警告、记过等党纪政纪处分，甚至可能涉及刑事责任。

三、资金追回

对于已经发放的“空饷”资金，必须全力追回。这可以通过与涉事人员协商、法律诉讼等方式进行。追回的资金应上缴国库，以弥补财政损失。

四、制度完善

为了避免类似问题的再次发生，自来水公司及相关部门应深入分析问题根源，完善相关制度和管理机制。这包括加强人员编制管理、完善考勤制度、强化监督制约机制等。同时，还应加强对公职人员的职业道德教育和纪律教育，提高他们的纪律意识和法律意识。

五、公开透明

对于“吃空饷”问题的处理结果，应及时向社会公开，接受群众监督。这不仅可以增强处理结果的公信力，还可以起到警示作用，防止类似问题的再次发生。

以甘肃省白银市会宁县自来水公司总经理邵正军为例，他因滥权妄为致使单位发生“吃空饷”问题而被开除党籍和公职。这一案例充分说明了对于“吃空饷”行为的零容忍态度和处理力度。

综上所述，对于自来水公司“吃空饷20万”的问题，必须依法依规进行严肃处理，包括调查核实、责任追究、资金追回、制度完善和公开透明等方面。只有这样，才能维护公职人员的职业道德和纪律要求，保障公共利益和政府形象。