结论：母亲代儿子签了还货款协议是否有效，需根据具体情况判断，主要取决于儿子是否授权母亲代签以及该授权是否合法有效。
分析如下：
有授权且授权合法有效的情况：
- 如果儿子在坐牢前或坐牢期间，通过合法方式（如书面委托、公证委托等）明确授权母亲代为签署还货款协议，且该授权没有违反法律法规的强制性规定，那么母亲代签的协议是有效的。
- 在这种情况下，母亲作为儿子的代理人，其签署协议的行为视为儿子的行为，对儿子具有法律约束力。
无授权或授权不合法有效的情况：
- 如果儿子没有授权母亲代为签署还货款协议，或者授权方式不合法（如口头授权但无法证明、授权内容不明确等），那么母亲代签的协议可能无效。
- 在这种情况下，母亲的行为可能构成无权代理，除非儿子事后追认该协议，否则该协议对儿子不具有法律约束力。
法律背景与建议：
- 法律背景：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，代理人在代理权限内，以被代理人名义实施的民事法律行为，对被代理人发生效力。如果代理人没有代理权、超越代理权或者代理权终止后，仍然实施代理行为，除非被代理人追认，否则该行为对被代理人不发生效力。
- 建议：
- 如果母亲已经代儿子签署了还货款协议，建议尽快与儿子沟通，确认其是否授权母亲代签，并保留好相关授权证据。
- 如果儿子未授权或授权不合法，且对方已经依据该协议主张权利，建议及时咨询专业律师，评估协议效力及可能面临的法律风险，并制定相应的应对策略。
- 在未来类似情况下，建议尽量通过书面方式明确授权，并确保授权内容具体、明确，以避免不必要的法律纠纷。
可能法律后果：
- 如果协议有效，儿子需按照协议约定履行还款义务，否则可能面临违约责任。
- 如果协议无效，儿子无需履行还款义务，但可能因母亲的无权代理行为而承担一定的法律责任（如赔偿对方因协议无效而遭受的损失，但这一责任通常较小且需根据具体情况判断）。不过，在大多数情况下，如果母亲是无偿代理且没有过错，儿子可能无需承担此类责任。
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