结论：预付款不扣回预付款担保费是否合法，需根据合同的具体约定以及相关法律法规来判断。以下从不同角度进行分析：
合同约定角度：
- 合法情形：如果合同中明确约定了预付款担保费的支付方式，且未规定在特定条件下（如合同提前终止、预付款未使用等）需要扣回，那么不扣回预付款担保费是合法的。因为合同是双方意思自治的体现，只要合同内容不违反法律、行政法规的强制性规定，就应当受到法律保护。
- 不合法情形：反之，如果合同中明确约定了在某些条件下需要扣回预付款担保费，而实际未扣回，则可能构成违约。此时，未扣回预付款担保费的行为可能因违反合同约定而被认定为不合法。
法律法规角度：
- 一般原则：在法律法规没有明确规定预付款担保费必须扣回或不得扣回的情况下，主要依据合同约定来判断。法律法规通常不会直接干预合同双方关于费用支付的约定，除非该约定违反了法律、行政法规的强制性规定或公序良俗。
- 特殊规定：如果预付款担保费的支付与特定行业或领域的监管要求相关，且相关法律法规或监管规定明确要求了预付款担保费的扣回条件或方式，那么未按照这些规定扣回预付款担保费可能构成违法。但这种情况较为特殊，需要具体分析相关法律法规或监管规定的内容。
实际操作建议：
- 审查合同：首先，应仔细审查合同中关于预付款担保费的支付条款，明确双方的权利和义务。
- 沟通协商：如果合同中存在模糊或不明确的地方，建议与对方进行沟通协商，以达成一致意见并避免潜在的法律纠纷。
- 寻求法律帮助：如果无法通过沟通协商解决问题，或者对合同条款的理解存在争议，建议寻求专业律师的法律帮助。律师可以根据具体情况提供法律意见，并协助处理相关法律事务。
举例说明：假设甲乙双方签订了一份采购合同，合同中约定了预付款担保费的支付方式和金额，但未明确约定在合同提前终止时是否需要扣回预付款担保费。如果合同提前终止，且双方对预付款担保费的扣回问题产生争议，那么就需要根据合同的其他条款、交易习惯以及相关法律法规来综合判断不扣回预付款担保费是否合法。
进一步思考：在实际操作中，为了避免类似争议的发生，建议在签订合同时就明确约定预付款担保费的支付方式、金额以及扣回条件等关键条款。同时，双方也应加强沟通协商，确保对合同条款的理解一致，以减少潜在的法律风险。
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