结论：公司叫你自动离职，工资不一定会少，但具体是否会减少取决于多种因素。以下从不同角度为你详细分析：
一、工资支付的基本原则
根据我国相关法律法规，劳动者只要付出了劳动，就有权获得相应的劳动报酬，这是劳动者的基本权利，不受离职方式的影响。因此，无论你是主动离职还是被公司要求自动离职，公司都应当按照你实际工作的天数和劳动合同中约定的工资标准来支付工资。这是法律对劳动者权益的基本保障，确保你不会因离职而失去应得的报酬。
二、可能影响工资支付的情况
给公司造成损失：
- 如果你的自动离职行为给公司造成了经济损失，比如未按规定交接工作导致业务中断、泄露公司商业秘密等，公司有权要求你进行赔偿。
- 但此类赔偿需基于明确的证据证明损失的存在及具体数额，并且赔偿金额应合理。同时，扣除赔偿后的工资不得低于当地最低工资标准，以确保你的基本生活需求。
违反公司规章制度：
- 若公司的规章制度中明确规定了自动离职的相关处理方式，如扣除一定比例的工资等，且这些规章制度已经过民主程序制定，并向你进行了公示和告知，那么在符合规定的情况下，公司可以依据这些制度对工资进行相应处理。
- 但需要注意的是，这些规章制度的内容不能违反法律的强制性规定，否则将无效。例如，规章制度中不能规定“自动离职者工资全扣”等明显违法的条款。
三、维权途径
如果你在自动离职后遭遇公司拒绝支付工资或不合理扣除工资的情况，可以通过以下途径来维护自己的合法权益：
- 协商：首先尝试与公司进行协商，寻求和解。你可以向公司说明自己的权益和法律依据，要求公司按照法律规定支付工资。
- 投诉：若协商无果，你可以向当地的劳动监察部门进行投诉，请求其介入调查并处理。劳动监察部门有权对公司进行调查，并要求公司按照法律规定支付工资。
- 劳动仲裁：作为更进一步的措施，你还可以申请劳动仲裁，通过法律程序来解决争议。劳动仲裁委员会将根据双方提供的证据和法律规定进行裁决，确保你的权益得到充分保护。
四、建议
- 在离职前，建议你与公司进行充分沟通，明确离职的具体原因和工资支付情况，避免后续产生争议。
- 如果公司要求你自动离职并威胁扣除工资，你可以要求公司出具书面通知，并保留好相关证据，以便后续维权。
- 在整个过程中，保持冷静和理性，不要采取过激行为，以免给自己带来不必要的麻烦。
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