施工联合体协议在特定条件下可以更改联合体成员份额，但需严格遵守法律法规和合同约定。以下是对此问题的详细分析：
法律依据与分析
《中华人民共和国招标投标法》的相关规定：
- 根据该法第三十一条，联合体各方应签订共同投标协议，明确约定各方拟承担的工作和责任。这表明联合体成员之间的份额和责任分配是协议的重要内容，理论上可以通过协议变更来调整。
- 然而，第四十六条第一款规定，招标人和中标人不得再行订立背离合同实质性内容的其他协议。这意味着，如果更改联合体成员份额被视为对合同实质性内容的变更，那么这种变更将受到严格限制。
合同自由与限制：
- 合同自由原则允许当事人在不违反法律强制性规定的前提下，自由约定合同内容。因此，如果施工联合体协议中明确规定了更改成员份额的条件和程序，且这些条件和程序不违反法律强制性规定，那么更改成员份额是可能的。
- 但同时，合同自由也受到一定限制，特别是当涉及公共利益或第三方权益时。在施工联合体协议中，更改成员份额可能影响到项目的实施、质量、安全等方面，因此必须谨慎处理。
实际操作中的考量：
- 在实际操作中，更改联合体成员份额通常需要经过招标人的同意，因为招标人是项目的发起方和受益方，对联合体的构成和实力有合理期待。
- 此外，更改成员份额还可能涉及到其他联合体成员的利益调整，因此需要得到所有联合体成员的一致同意。
合同约定层面
- 施工联合体协议中的约定：如果协议中明确规定了更改成员份额的条件、程序和限制，那么应严格按照协议执行。例如，协议可能规定在特定情况下（如成员破产、丧失资质等），可以经过一定程序更改成员份额。
- 无约定或约定不明的情况：如果协议中没有明确规定更改成员份额的相关内容，或者约定不明，那么需要依据相关法律法规和行业惯例来处理。在这种情况下，更改成员份额可能面临更大的法律风险和不确定性。
法律建议与后果
法律建议：
- 在考虑更改施工联合体成员份额时，应首先审查协议中的相关条款，了解更改的条件和程序。
- 如果协议中没有明确规定或规定不明，建议咨询专业律师或相关机构，以获取更具体的法律意见和指导。
- 在更改成员份额前，应确保得到所有联合体成员和招标人的同意，并签订书面协议以明确各方的权利和义务。
可能的法律后果：
- 如果未经合法程序擅自更改施工联合体成员份额，可能构成对原协议的违约行为，需要承担违约责任。
- 如果更改行为违反了相关法律法规的强制性规定，还可能面临行政处罚或法律诉讼等风险。
总结来说，施工联合体协议在特定条件下可以更改联合体成员份额，但必须严格遵守法律法规和合同约定，并确保得到所有相关方的同意。在处理此类问题时，建议咨询专业律师以获取更具体的法律意见和指导。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。