结论：当合同甲方有两个人，而仅其中一人提起诉讼时，该行为在法律上是允许的，但具体处理方式需根据合同的性质、权利的可分割性以及《民事诉讼法》的相关规定来确定。以下是对此问题的详细分析：
从实体权利角度分析
- 权利可分割性：
- 可分割权利：如果合同中约定的权利是可分割的，例如甲乙两人分别与丙签订合同，各自享有独立的金钱债权（如甲享5万元，乙享3万元），则提起诉讼的一方仅能就自己所享有的那部分权利主张，法院也仅对该部分进行审理和裁判，不涉及未起诉一方的权利。
- 不可分割权利：若合同权利不可分割，如甲乙共同承租丙的房屋，租金支付、房屋使用等构成一个整体，此时单个提起诉讼的一方不能完全代表整个合同相对方的利益。法院可能通知未起诉方作为共同原告参加诉讼；若未起诉方明确表示放弃权利，则法院仅对起诉方进行审理；若未起诉方既不参加也不放弃，法院应在判决中明确其权利义务。
从诉讼程序角度分析
诉讼主体资格：
- 提起诉讼的一方作为合同当事人，自然具备诉讼主体资格。但由于合同相对方为两人，法院在审理过程中会特别关注证据的完整性及对合同约定的全面理解，以确保公正裁判。
起诉条件与法律依据：
- 根据《民事诉讼法》的相关规定，起诉必须满足原告资格、明确被告、具体诉讼请求和事实理由以及法院管辖等条件。只要提起诉讼的一方符合这些条件，法院就应受理案件。
- 具体来说，《民事诉讼法》第一百一十九条规定了起诉的基本条件，而第一百二十三条则保障了当事人的起诉权利，并规定了立案的时限。同时，第五十五条涉及共同诉讼的规定，指出在诉讼标的是共同或同一种类且经当事人同意的情况下，可进行合并审理。
实际操作建议
- 关注诉讼进展：未起诉的合同当事人应密切关注诉讼进展，如有必要，可申请作为共同原告参与诉讼，以维护自身权益。
- 准备必要证据：无论是提起诉讼的一方还是未起诉的一方，都应准备充分的证据来支持自己的主张或抗辩。
- 咨询专业律师：在涉及复杂合同纠纷时，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。虽然此处我作为王胜利律师已经给出了一些基本分析，但每个案件的具体情况都有所不同，因此专业律师的个性化建议至关重要。
综上所述，合同甲方有两人时，其中一人提起诉讼是合法的，但具体处理需结合合同性质、权利的可分割性以及民事诉讼法的相关规定来综合判断。在实际操作中，各方应密切关注诉讼动态，并适时采取必要的法律措施以保护自身权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。