结论：行政机关在案件调查中发现违法行为已达刑事标准，但违法行为人已死亡的情况下，一般仍需将案件移送至司法机关，但司法机关在受理后可能会根据具体情况作出终止审理或不予起诉的决定。以下从不同角度进行详细分析：
一、案件移送的必要性
法律程序的要求：
- 根据相关法律法规，行政机关在调查过程中发现案件涉嫌犯罪的，应当及时将案件移送至司法机关处理。这是法律程序的基本要求，旨在确保案件得到公正、专业的处理。
案件性质的认定：
- 尽管违法行为人已死亡，但案件的性质（即是否构成犯罪）并未因此改变。行政机关有义务将案件移送至司法机关，由司法机关对案件进行进一步的审查和认定。
二、司法机关的处理方式
终止审理：
- 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，在审判过程中，如果被告人死亡，法院应当裁定终止审理。这是因为刑事诉讼的目的是对被告人进行定罪量刑，而被告人死亡后，这一目的已无法实现。
不予起诉：
- 在审查起诉阶段，如果检察机关认为犯罪嫌疑人已死亡，且没有其他需要追究刑事责任的人或事实，可以作出不起诉的决定。这也是基于刑事诉讼目的无法实现的考虑。
三、特殊情况下的处理
涉及财产追缴或没收：
- 如果案件涉及违法所得的追缴或没收，即使违法行为人已死亡，司法机关仍可能继续处理相关财产问题。这是因为财产追缴或没收是独立于刑事诉讼的民事或行政程序，不受被告人死亡的影响。
共同犯罪中的其他被告人：
- 如果案件是共同犯罪，且还有其他被告人在世，司法机关将继续对其他被告人进行审理和定罪量刑。违法行为人的死亡不影响对其他被告人的刑事责任追究。
四、实际操作中的建议
及时移送案件：
- 行政机关在发现案件涉嫌犯罪后，应及时将案件移送至司法机关，避免因延误移送而影响案件的公正处理。
配合司法机关工作：
- 在案件移送后，行政机关应积极配合司法机关的工作，提供必要的证据和资料，协助司法机关对案件进行进一步的审查和认定。
关注案件进展：
- 行政机关可以关注案件的进展情况，了解司法机关的处理结果，以便在必要时采取进一步的措施或提供必要的协助。
总结：行政机关在案件调查中发现违法行为已达刑事标准，但违法行为人已死亡的情况下，仍需将案件移送至司法机关。司法机关在受理后将根据具体情况作出终止审理或不予起诉的决定，并可能继续处理相关财产问题或对其他被告人进行审理。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。