针对您提出的“员工上班出车祸且工作不满3个月申请劳动仲裁该如何处理”这一问题，核心结论是：员工可依法申请劳动仲裁，主张工伤赔偿及相关权益，用人单位需积极应对，否则可能面临不利法律后果。以下从员工和用人单位两个角度展开说明：

一、员工角度：如何申请劳动仲裁及主张权益

1. 确认劳动关系
   即使工作不满3个月，只要存在事实劳动关系（如签订劳动合同、工资发放记录、考勤记录等），员工均有权申请劳动仲裁。若未签合同，可通过工资转账记录、工作证、同事证言等证据证明劳动关系。

2. 申请工伤认定
   根据《工伤保险条例》，员工在上下班途中受到非本人主要责任的交通事故伤害，应认定为工伤。需在事故发生后1年内向当地社保部门申请工伤认定，并提交以下材料：

   • 工伤认定申请表；
     
   • 劳动关系证明；
     
   • 医疗诊断证明；
     
   • 交通事故责任认定书（需证明员工无责或次责）。

3. 劳动仲裁请求事项
   若用人单位未缴纳社保或拒绝赔偿，员工可申请劳动仲裁，主张以下权益：

   • 工伤医疗费、康复费；
     
   • 停工留薪期工资（按原工资福利支付）；
     
   • 一次性伤残补助金（若构成伤残）；
     
   • 未签劳动合同的双倍工资差额（最多11个月，但工作不满3个月可主张2个月差额）；
     
   • 解除劳动合同的经济补偿（若因工伤被迫离职）。

4. 流程提示

   • 劳动仲裁时效为1年，自知道或应当知道权益受损之日起计算；
     
   • 仲裁前可尝试与用人单位协商，若协商无果再申请仲裁；
     
   • 仲裁裁决后，若用人单位不履行，可向法院申请强制执行。

二、用人单位角度：如何应对劳动仲裁

1. 核实工伤事实
   用人单位需配合社保部门调查，提供事故现场证据、监控录像等，确认员工是否在上下班合理路线、合理时间内发生事故，以及交通事故责任划分。

2. 检查社保缴纳情况
   若未缴纳工伤保险，用人单位需承担全部工伤赔偿费用（包括医疗费、伤残补助金等）；若已缴纳，则由工伤保险基金支付部分费用，用人单位承担停工留薪期工资等。

3. 应对仲裁请求

   • 双倍工资差额：若未签合同，用人单位需支付工作不满3个月的双倍工资差额（即再支付2个月工资）；
     
   • 经济补偿：若员工以“未缴纳社保”或“未支付工伤待遇”为由解除合同，用人单位可能需支付经济补偿（半个月工资）；
     
   • 证据准备：用人单位需提供劳动合同、工资表、考勤记录等证据，反驳员工不合理请求。

4. 和解或调解
   仲裁前或仲裁中，用人单位可主动与员工协商，达成和解或调解协议，降低时间成本和法律风险。

三、关键风险提示

1. 员工未签合同的风险：即使工作不满3个月，用人单位也需支付双倍工资差额；
   
2. 工伤认定的时效性：员工需在1年内申请工伤认定，否则可能丧失权利；
   
3. 用人单位拒不赔偿的后果：若仲裁裁决生效后仍不履行，员工可申请法院强制执行，用人单位可能被列入失信名单。

建议：若您是员工，尽快收集证据申请工伤认定和劳动仲裁；若您是用人单位，建议委托律师协助处理，避免因程序瑕疵或证据不足导致败诉。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作细节。