经司法确认的调解协议中约定不得再主张工伤赔偿的，该约定是否有效，需分情况讨论：

1. 若调解协议内容合法且双方自愿达成：

   • 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的相关规定，经劳动争议调解组织调解达成的调解协议，具有法律约束力，双方应当履行。若该调解协议已经司法确认，即获得了法院的强制执行力，那么协议中的内容，包括“不得再主张工伤赔偿”的约定，在双方自愿且不违反法律强制性规定的前提下，是有效的。
   • 举例：假设员工在工伤发生后，与用人单位在调解组织的调解下，自愿达成了包含“员工放弃后续工伤赔偿请求权”的调解协议，并且该协议经过了法院的司法确认。在此情况下，员工再主张工伤赔偿的，法院通常不会支持。

2. 若调解协议存在违法情形或非双方自愿达成：

   • 如果调解协议中的“不得再主张工伤赔偿”条款，是在一方受到胁迫、欺诈或者协议内容显失公平等情形下签订的，那么该条款可能因违反法律强制性规定或公序良俗而被认定为无效。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效，违背公序良俗的民事法律行为也无效。此外，如果一方以欺诈、胁迫的手段，使对方在违背真实意思的情况下实施的民事法律行为，受欺诈方或受胁迫方有权请求人民法院或者仲裁机构予以撤销。
   • 举例：假设用人单位利用员工急需医疗费用的心理，迫使员工在调解协议上签字，放弃后续工伤赔偿请求权，且该协议内容明显对员工不利。在此情况下，员工有权向法院申请撤销该协议中的相关条款，并继续主张工伤赔偿。

3. 若调解协议未涵盖全部工伤赔偿项目或存在遗漏：

   • 即使调解协议已经司法确认，但如果协议中未涵盖员工应享有的全部工伤赔偿项目，或者存在其他遗漏情形，员工仍有权就未涵盖或遗漏的部分向用人单位主张赔偿。
   • 举例：假设调解协议仅就员工的医疗费和误工费进行了约定，但未涉及伤残补助金、一次性工伤医疗补助金等赔偿项目。在此情况下，员工仍有权就这些未约定的赔偿项目向用人单位主张权利。

建议：

• 在签订调解协议前，员工应充分了解自己的工伤赔偿权益，确保协议内容全面、合法且公平。
• 如果对调解协议的内容存在疑问或不确定，建议咨询专业律师，以避免因不了解法律而损害自己的合法权益。
• 若已经签订了调解协议并经过了司法确认，但后来发现协议存在违法情形或非自愿达成，应及时向法院申请撤销或变更相关条款。

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