核心结论：发现进厂上班两天后工资由中介发放，可能涉及劳务派遣、中介违规操作等情况，存在一定法律风险，你可以从以下方面应对：

1. 明确用工关系
   • 首先，要弄清楚你与工厂、中介之间究竟是何种法律关系。如果工厂是通过正规劳务派遣的方式用工，即工厂与劳务派遣单位（中介）签订劳务派遣协议，劳务派遣单位与你签订劳动合同，将你派遣到工厂工作，那么由中介发放工资是符合法律规定的。在这种情况下，中介作为用人单位，有义务按照劳动合同的约定及时足额支付你工资。你可以要求中介提供与你签订的劳动合同，查看其中关于工资支付的相关条款，确认工资支付主体、支付时间、支付方式等内容是否符合约定。
   • 若工厂与中介之间并非正规的劳务派遣关系，而是工厂为了规避用工责任，与中介私下合作，由中介招聘你并支付工资，但你实际在工厂工作，接受工厂的管理和指挥，那么这种用工模式可能存在违法之处。此时，工厂与你之间可能构成事实劳动关系，工厂应当承担用人单位的责任，包括支付工资、缴纳社会保险等。你可以收集能证明你在工厂工作的相关证据，如工作证、考勤记录、工作服、与工厂管理人员的聊天记录等，以备后续维权使用。
2. 核实工资支付情况
   • 仔细查看中介发放工资的方式和金额是否符合约定。如果中介未按照约定时间、金额支付工资，你有权要求中介立即支付。你可以与中介沟通，明确指出其违约行为，并要求其给出合理的解释和解决方案。如果中介拒绝支付或拖延支付，你可以保留好相关证据，如工资条、银行转账记录、与中介沟通的聊天记录等，以便后续通过法律途径维护自己的权益。
   • 同时，要注意工资的计算方式是否合法。根据法律规定，用人单位支付给劳动者的工资不得低于当地最低工资标准，且应当按照国家规定计算加班工资等。如果中介发放的工资低于最低工资标准或未依法计算加班工资，你可以要求中介补足差额。
3. 考虑维权途径
   • 协商解决：你可以先尝试与中介和工厂进行协商，表达你的诉求和关切，争取通过友好协商的方式解决问题。在协商过程中，要保持冷静和理性，明确提出你的合理要求，并听取对方的意见和建议，寻求双方都能接受的解决方案。
   • 投诉举报：如果协商无果，你可以向当地劳动监察部门投诉举报。劳动监察部门有权对用人单位的用工行为进行监督检查，对违反劳动法律法规的行为进行查处。你可以向劳动监察部门提供相关证据，如劳动合同、工资条、考勤记录等，要求劳动监察部门介入调查，并责令中介和工厂改正违法行为，支付你应得的工资。
   • 申请劳动仲裁：如果通过投诉举报仍未能解决问题，你可以向当地劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁。劳动仲裁是解决劳动争议的一种重要方式，具有快捷、高效、成本低等优点。在申请劳动仲裁时，你需要提交仲裁申请书和相关证据材料，仲裁委员会将依法受理并进行审理，作出裁决。如果你对仲裁裁决不服，还可以在规定的时间内向人民法院提起诉讼。

在处理此类问题时，要保留好相关证据，以便在需要时能够证明自己的权益。如果你在处理过程中遇到任何疑问或困难，都可以随时向我咨询。