公司不能仅通过短信形式通知员工解除劳动关系，这种做法通常是不合法的。以下从多个角度为你详细分析：
法律依据与解除程序
根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关法律法规，用人单位在解除劳动合同时，必须遵循法定的程序和规定。这包括但不限于提前通知劳动者、明确解除原因、支付经济补偿（如适用）等。这些规定旨在保障劳动者的合法权益，确保双方权益得到公正、合理的处理。其中，书面形式是法律所明确要求的通知方式，它具备明确性、清晰度以及法律严肃性和权威性，有助于维护法律的尊严和公信力，同时也便于证据留存和查证。
短信方式的不足与风险
信息不完整与易误读：短信由于篇幅限制，往往无法全面、详细地传达解除劳动合同的所有关键信息，如解除原因、具体时间、经济补偿等。这容易导致信息不完整或被误读，从而引发不必要的纠纷。
安全性与稳定性差：短信容易被删除、篡改或丢失，这不利于保障信息的完整性和真实性。在劳动纠纷发生时，短信作为证据的严谨性往往受到质疑，难以满足法律要求。
法律效力争议：由于短信不符合法律所要求的书面形式，其法律效力往往受到质疑。在司法实践中，单纯的短信方式解除劳动合同可能被认定为无效的解除行为，从而引发法律风险和纠纷。
合法解除劳动关系的建议
书面通知：公司应当采用书面形式通知员工解除劳动关系，并确保通知内容明确、清晰，包含解除原因、时间、经济补偿等关键信息。
提前沟通：在发出书面通知前，公司可以与员工进行提前沟通，解释解除劳动关系的原因和后续安排，以减少员工的疑虑和不满。
支付经济补偿：如果解除劳动关系符合支付经济补偿的条件，公司应当按照法律规定支付相应的经济补偿，以保障员工的合法权益。
办理离职手续：公司应当协助员工办理离职手续，如交接工作、归还公司财物等，以确保离职过程的顺利进行。
特殊情况下的处理
虽然短信不能作为解除劳动合同的主要方式，但在某些特殊情况下，如紧急情况下需要立即解除劳动关系，且无法及时采用书面形式通知时，公司可以先通过短信等方式提前告知员工，并尽快补发书面通知。然而，这一做法仍存在法律风险，因此公司应尽量避免采用，并确保在后续及时补发规范的书面解除劳动合同通知。
总结与建议：公司在解除劳动合同时，必须严格遵守《劳动合同法》等相关法律法规的规定，以书面形式通知劳动者，并确保解除程序的合法性和严谨性。如果你或你身边的人遇到了公司以短信形式通知解除劳动关系的情况，建议及时咨询专业律师（即我本人，韦海团律师，专注于工伤赔偿、刑事辩护、离婚领域），以了解具体的法律权益和应对策略。