公休两天通常不算缺勤，但具体是否算缺勤，需要结合公司的规章制度以及劳动合同中的相关约定来判断。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
公司规章制度的角度：
- 许多公司会在其规章制度中明确规定员工的休假制度，包括公休日的安排。如果公司的规章制度中明确指出公休日是员工的正常休息日，且不计入缺勤，那么员工在公休日休息自然不算缺勤。
- 反之，如果公司的规章制度中有特殊规定，比如将某些公休日视为工作日，或者要求员工在公休日进行加班或调休，并且未明确说明这种情况下不算缺勤，那么员工就需要按照公司的规定执行，否则可能被视为缺勤。
劳动合同的角度：
- 劳动合同是员工与公司之间约定双方权利和义务的法律文件。如果劳动合同中明确规定了员工的休假制度，包括公休日的安排，并且指出公休日不算缺勤，那么员工在公休日休息就是合法的，不算缺勤。
- 如果劳动合同中没有明确规定，或者规定与公司的规章制度存在冲突，那么就需要根据具体情况进行协商或依据相关法律法规进行判断。
法律法规的角度：
- 根据《中华人民共和国劳动法》等相关法律法规，员工享有休息休假的权利。公休日作为员工正常的休息日，通常是不计入工作时间的，因此也不算缺勤。
- 但是，如果公司因生产经营需要，经与工会和劳动者协商后可以延长工作时间，即安排加班。在这种情况下，如果公司未按照法律规定支付加班费或安排调休，员工有权拒绝加班，并且这种拒绝不应被视为缺勤。
建议：
- 如果你对公司的规章制度或劳动合同中的休假条款有疑问，建议仔细阅读相关条款，并与公司的人力资源部门或上级进行沟通，以明确自己的权利和义务。
- 如果公司存在违反法律法规或劳动合同约定的行为，比如无故将公休日视为缺勤并扣除工资，你可以向当地的劳动监察部门投诉或寻求法律援助。
总之，公休两天是否算缺勤，需要综合考虑公司的规章制度、劳动合同以及相关法律法规的规定。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。