财务总监在查处巨大补税款的情况下是否负有责任，需根据具体情况分析，不能一概而论。以下从不同角度进行详细阐述：

1. 财务总监的职责范围：

   • 财务总监作为公司财务管理的高级负责人，通常负责公司的财务规划、预算控制、资金管理、税务筹划等工作。在税务方面，财务总监有责任确保公司遵守相关税法规定，及时、准确地申报和缴纳税款。

2. 补税款的原因分析：

   • 如果补税款是由于公司之前的税务筹划存在漏洞或错误，导致少缴、漏缴税款，那么财务总监作为税务筹划的主要负责人，可能需要承担一定的责任。这种责任可能包括行政责任（如税务机关的处罚）或民事责任（如对公司造成的损失进行赔偿）。
   • 如果补税款是由于公司业务变化、政策调整等外部因素导致的，且财务总监已经尽到了合理的注意义务和申报义务，那么财务总监可能不需要承担责任。

3. 财务总监的责任形式：

   • 行政责任：如果财务总监在税务方面存在违法行为，如故意隐瞒收入、虚报支出等，税务机关有权对其进行处罚，包括罚款、滞纳金等。
   • 民事责任：如果财务总监的过错行为导致公司遭受损失，如因少缴税款而被税务机关处罚，公司有权要求财务总监承担赔偿责任。
   • 刑事责任：在极端情况下，如果财务总监的违法行为构成犯罪，如逃税罪等，那么其可能面临刑事责任的追究。

4. 具体案例分析：

   • 假设某公司因财务总监的疏忽或故意行为导致少缴税款数百万，税务机关在查处后要求公司补缴税款并缴纳滞纳金。在此情况下，财务总监可能需要承担行政责任和民事责任。如果其行为构成逃税罪，还可能面临刑事责任的追究。
   • 另一方面，如果公司因业务扩张导致税负增加，财务总监已经按照税法规定进行了申报和缴纳，但税务机关在后续检查中发现公司存在某些税务风险点并要求补缴税款。在此情况下，财务总监可能不需要承担责任，因为其已经尽到了合理的注意义务和申报义务。

5. 建议与措施：

   • 对于财务总监而言，应加强对税法规定的学习和理解，确保公司的税务筹划和申报工作符合法律要求。
   • 公司应建立健全的内部控制制度，加强对财务工作的监督和检查，及时发现和纠正潜在的税务风险。
   • 在面临税务机关的检查或处罚时，财务总监应积极配合税务机关的工作，提供必要的资料和解释，以减轻或避免责任。

总结来说，财务总监在查处巨大补税款的情况下是否负有责任，取决于其职责范围、补税款的原因以及是否存在违法行为等因素。如有具体法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。