在工伤事故中，即使第三方对伤害负全责，公司依然需要承担一定的赔偿责任。这一结论是基于相关法律法规及工伤保险制度的设计原则得出的，以下是对此问题的全面分析：
一、工伤保险的基本原则与单位责任
工伤保险是法定的社会保险，旨在为因工作遭受事故伤害或患职业病的职工提供医疗救治和经济补偿。根据《工伤保险条例》的规定，员工发生工伤事故，无论是否由第三方造成，均有权享受工伤保险待遇。这意味着，工伤保险的赔付与员工是否在工作中受伤以及事故责任归属无关，而是基于员工与用人单位之间的劳动关系。
二、单位在工伤事故中的具体赔偿责任
缴纳工伤保险的情况：
- 工伤保险基金支付：包括医疗费用、康复费用、住院伙食补助费、交通食宿费、伤残辅助器具费、生活护理费、一次性伤残补助金、伤残津贴、一次性医疗补助金、丧葬补助金、供养亲属抚恤金、因工死亡补助金及劳动能力鉴定费等。这些费用由工伤保险基金承担，但单位有义务协助员工进行工伤认定和申请工伤保险赔偿。
- 用人单位支付：治疗工伤期间的工资福利、五级至六级伤残职工的伤残津贴、一次性伤残就业补助金等。这些费用由用人单位直接支付给员工。
未缴纳工伤保险的情况：
- 若用人单位未履行缴纳工伤保险的法定义务，则原本应由工伤保险基金支付的所有费用将由用人单位全额承担。这是为了督促用人单位遵守法律，保障员工权益。
三、第三方赔偿与工伤保险的关系
在工伤事故中，如果存在第三方侵权（如交通事故中的对方司机），员工原则上可以获得双重赔偿。但实际操作中需注意避免重复获赔，特别是医疗费等直接损失项目通常遵循填平原则。即，员工从第三方获得的赔偿与从工伤保险获得的赔偿之和，不应超过其实际损失。
- 双重赔偿项目：如一次性伤残补助金、一次性伤残就业补助金等，员工可分别从工伤保险和侵权方处获得赔偿。
- 不重复支付项目：如医疗费用，若已从第三方获得部分赔偿，工伤保险基金或用人单位可能只需对不足部分进行补充支付。
四、单位义务与员工权益保护
- 单位义务：单位有义务协助员工进行工伤认定和申请工伤保险赔偿，确保员工能够及时获得救治和补偿。同时，单位还需支付治疗工伤期间的工资福利等费用。
- 员工权益保护：若单位未按规定给予员工应有的工伤保险待遇，员工可向当地劳动监察部门投诉，并寻求法律援助以维护自身合法权益。
五、实例说明
假设某员工在工作中受伤，停工留薪期为3个月，月工资5000元。同时，该事故由第三方造成，且第三方已承担部分医疗费用。在此情况下：
- 单位责任：单位需支付员工停工留薪期间的原工资福利待遇（即3个月×5000元/月=15000元）。若员工被鉴定为伤残且难以安排工作，单位还需按月发放伤残津贴。
- 工伤保险与第三方赔偿：员工可从工伤保险基金获得除医疗费用外的其他待遇（如一次性伤残补助金等）。对于医疗费用，若第三方已承担部分，工伤保险基金或单位可能只需对不足部分进行补充支付。
综上所述，即使在工伤事故中第三方负全责，公司仍需根据工伤保险制度的相关规定承担赔偿责任。员工在获得第三方赔偿的同时，仍有权依法享受工伤保险待遇。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。