若乙方违反基本农田租赁合同，甲方可以采取以下法律措施维护自身权益：

1. 确认合同效力与违约情形
   首先需审查租赁合同是否合法有效。根据《农村土地承包法》及《民法典》相关规定，基本农田租赁需满足：

   • 合同主体适格（如甲方为合法承包经营权人，乙方具备民事行为能力）；
     
   • 内容合法（不得改变农田用途为非农建设，租赁期限不超过法定剩余承包期）；
     
   • 程序合规（如经发包方备案或同意，若涉及集体土地）。
     若合同有效，乙方违约行为可能包括：拒付租金、擅自转租、改变农田用途、破坏土地等。甲方需固定证据（如书面催告记录、现场照片、证人证言等）。

2. 根据违约类型选择救济途径

   • 要求继续履行：若乙方仅拖欠租金但未根本违约，甲方可发函催告并要求限期支付，逾期可主张解除合同并索赔损失。
     
   • 解除合同并索赔：若乙方存在根本违约（如擅自建房、撂荒导致土地严重损害），甲方可依据《民法典》第563条单方解除合同，并要求乙方：
     
     • 恢复土地原状（如拆除违建、清理杂物）；
       
     • 赔偿损失（包括直接损失如租金损失、间接损失如土地复垦费用）；
       
     • 支付违约金（若合同有约定）。
       
   • 行政投诉：若乙方行为违反《土地管理法》（如非法占地），甲方可向当地自然资源部门举报，由行政部门责令整改或处罚。

3. 诉讼或仲裁程序

   • 起诉流程：甲方需准备起诉状、证据材料（合同、违约证据、损失凭证等），向被告住所地或合同履行地法院提起民事诉讼。
     
   • 仲裁条款：若合同约定仲裁条款，需向约定的仲裁机构申请仲裁（注意：农村土地纠纷通常以诉讼为主，仲裁需双方明确约定）。
     
   • 执行保障：胜诉后若乙方拒不履行，可申请法院强制执行，包括查封财产、限制高消费等。

4. 风险提示与预防建议

   • 合同条款完善：未来签订合同时应明确：
     
     • 土地用途限制（如仅限农业种植）；
       
     • 违约责任（如违约金比例、损失计算方法）；
       
     • 争议解决方式（诉讼或仲裁）。
       
   • 动态监管：租赁期间定期检查土地使用情况，发现违约及时制止并留存证据。
     
   • 政策合规：确保租赁行为符合当地“三权分置”政策，避免因程序瑕疵导致合同无效。

行动建议：建议甲方先与乙方协商补救措施（如补缴租金、限期整改），若协商无果，尽快委托律师起草律师函或直接起诉，避免因拖延导致损失扩大。如有具体证据或合同条款需要分析，可进一步提供细节，我将协助制定诉讼策略。