公司收到的货物可能因上游虚开增值税发票而受到影响，需谨慎处理。

首先，我们要明确的是，虚开增值税发票是违法行为，不仅会对上游企业造成严重后果，也可能对下游企业（即你的公司）带来一定的法律风险和财务影响。针对你公司当前的情况，我有以下几点建议：

1. 立即核实发票情况：

   • 检查收到的发票是否真实有效，是否存在虚开的情况。
   • 如果发现发票有问题，应立即与上游企业沟通，并要求其提供合法有效的发票。

2. 评估法律风险：

   • 分析公司是否因接收了虚开的发票而涉及任何法律风险。
   • 如果存在风险，应尽快咨询税务部门或专业律师，了解可能的法律后果及应对措施。

3. 配合调查：

   • 如果税务部门或公安机关对上游企业的虚开行为展开调查，你的公司应积极配合，提供必要的资料和信息。
   • 同时，也要做好内部自查，确保公司没有参与任何违法违规行为。

4. 调整业务关系：

   • 考虑到上游企业存在的法律风险，你的公司可能需要重新评估与上游企业的业务关系。
   • 如果上游企业的信誉和法律合规性存在问题，建议考虑寻找其他可靠的供应商或合作伙伴。

5. 加强内部管理：

   • 建立健全的财务管理和发票管理制度，确保公司接收的每一张发票都是合法有效的。
   • 定期对员工进行法律培训和合规教育，提高员工的法律意识和合规意识。

总之，面对上游企业虚开增值税发票的情况，你的公司需要谨慎处理，确保自身的合法权益不受损害。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。