结论：司机受伤后运输公司仅赔偿一半是否合法，需根据具体情况判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
一、若司机受伤属于工伤范畴
法律依据：
- 根据《工伤保险条例》的相关规定，职工因工作遭受事故伤害或者患职业病进行治疗，享受工伤医疗待遇。
- 工伤赔偿的范围和标准由法律明确规定，包括医疗费、停工留薪期工资、护理费、一次性伤残补助金等。
分析：
- 如果司机受伤被认定为工伤，那么运输公司应按照《工伤保险条例》的规定承担全部赔偿责任，而不是仅赔偿一半。
- 运输公司若未依法为司机缴纳工伤保险费，发生工伤事故的，由运输公司支付工伤保险待遇。此时，运输公司更无权仅赔偿一半。
二、若司机受伤不属于工伤范畴，但运输公司存在过错
法律依据：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，行为人因过错侵害他人民事权益造成损害的，应当承担侵权责任。
- 如果运输公司在司机受伤事件中存在过错（如未提供安全的工作环境、未进行必要的安全培训等），则应承担相应的赔偿责任。
分析：
- 在这种情况下，运输公司应承担的赔偿责任应根据其过错程度、司机受伤的具体情况以及相关法律法规的规定来确定。
- 如果运输公司仅赔偿一半，而司机认为该赔偿金额不足以弥补其损失，司机可以通过法律途径（如起诉）来要求运输公司承担更多的赔偿责任。
三、若司机受伤既不属于工伤范畴，运输公司也无过错
- 分析：
- 在这种情况下，司机受伤可能被视为意外事件或个人原因导致，运输公司可能无需承担赔偿责任。
- 但如果司机与运输公司之间存在某种合同关系（如雇佣合同、承揽合同等），且合同中约定了运输公司在特定情况下的赔偿责任，那么运输公司应按照合同约定来承担赔偿责任。不过，这并不意味着运输公司可以随意决定赔偿金额，合同中的赔偿条款也应符合法律法规的规定。
四、特殊情况：第三方责任
- 如果司机受伤是由第三方（如其他车辆驾驶员、行人等）造成的，那么司机应首先向第三方主张赔偿。
- 在这种情况下，运输公司可能无需直接承担赔偿责任，但如果运输公司未尽到安全保障义务（如未提供安全的车辆、未进行必要的安全提示等），也可能需要承担一定的补充责任。不过，这并不意味着运输公司可以仅赔偿一半，其具体责任应根据实际情况和相关法律法规来确定。
建议：
- 司机在受伤后，应首先确定自己是否属于工伤范畴，并尽快进行工伤认定。
- 如果属于工伤范畴，司机应要求运输公司按照《工伤保险条例》的规定承担全部赔偿责任。
- 如果不属于工伤范畴，但运输公司存在过错，司机可以通过法律途径来要求运输公司承担相应的赔偿责任。
- 在任何情况下，司机都应保留好相关证据（如医疗记录、事故现场照片、证人证言等），以便在需要时维护自己的合法权益。
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