当房产证借给别人用于抵押担保贷款，且司法拍卖后所得款项不足以偿还全部债务时，剩余部分应由债务人负责偿还。以下是对此问题的详细解答：

1. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，抵押财产折价或者拍卖、变卖后，其价款超过债权数额的部分归抵押人所有，不足部分由债务人清偿。

2. 债务人的责任：

   • 债务人需对未清偿的债务承担继续偿还的责任。即使抵押物（房产证所代表的房产）已被拍卖，但仍有差额的部分，债务人需以其自身的其他财产来进行清偿。

3. 债权人的权利：

   • 债权人不能就此放弃追索剩余债务的权利，仍有权向债务人继续主张。
   • 债权人可以通过与债务人协商的方式，制定合理的还款计划，以逐步偿还剩余债务。
   • 如果债务人拒绝履行还款义务或缺乏偿还能力，债权人可以通过法律途径来维护自己的权益，包括向人民法院提起诉讼，请求法院对债务人的其他财产进行查封、扣押、冻结等强制执行措施。

4. 其他可能的法律途径：

   • 如果债务人确实无力偿还债务且资不抵债，债权人可以向人民法院申请对债务人进行破产清算，通过破产程序来分配债务人的财产以偿还债务。

综上所述，当房产证借给别人用于抵押担保贷款，且司法拍卖后所得款项不足以偿还全部债务时，债权人仍有权向债务人追偿剩余部分。债务人需以其自身的其他财产来继续清偿债务，直至全部债务得到清偿。如果在此过程中遇到任何法律问题或困难，你可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律帮助。