结论：单位在已经发放工资后，再要求修改之前发放的工资为劳动合同工资，这一行为是否合法及如何处理，需根据具体情况来判断。以下是从不同角度的详细分析：

1. 劳动合同的约定与工资发放的实际情况

   • 劳动合同约定：首先，要查看劳动合同中关于工资的具体约定。如果劳动合同中明确规定了工资的数额、支付方式等，那么单位应当按照劳动合同的约定来支付工资。
   • 工资发放实际情况：如果单位已经按照某种方式（可能是高于或低于劳动合同约定的数额）发放了工资，并且员工已经接受，这在一定程度上可以视为双方对工资支付方式的实际履行和认可。

2. 单位要求修改工资的合法性

   • 合法修改情形：如果单位因为经营状况变化、员工岗位调整等原因，需要调整工资，并且这种调整是合理的、符合法律法规的，同时与员工进行了充分的沟通和协商，那么单位可以提出修改工资的要求。但这种情况下，通常需要签订书面的工资变更协议。
   • 非法修改情形：如果单位无正当理由，单方面要求修改已经发放的工资，将其变更为劳动合同工资（尤其是当劳动合同工资低于实际发放工资时），这可能构成违法行为。员工有权拒绝这种无理要求，并可以依据相关法律法规维护自己的合法权益。

3. 员工的应对措施

   • 与单位协商：员工可以先与单位进行协商，了解单位要求修改工资的具体原因和依据，尝试达成共识。
   • 保留证据：员工应保留好工资条、银行转账记录等证据，以证明单位已经按照某种方式发放了工资。
   • 寻求法律帮助：如果协商无果，员工可以寻求法律帮助，比如向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，以维护自己的合法权益。

4. 可能的法律后果

   • 如果单位行为合法：如果单位要求修改工资的行为是合法的，并且与员工达成了共识，那么双方可以签订书面的工资变更协议，并按照新的协议执行。
   • 如果单位行为非法：如果单位要求修改工资的行为是非法的，员工有权拒绝，并可以要求单位按照实际发放的工资继续支付。如果单位坚持非法修改，员工可以通过法律途径追究单位的法律责任，包括要求单位支付拖欠的工资、经济补偿金等。

建议：面对单位要求修改已经发放的工资为劳动合同工资的情况，员工应保持冷静，先与单位进行协商，并保留好相关证据。如果协商无果或单位行为明显违法，员工应及时寻求法律帮助，以维护自己的合法权益。如果你在此过程中有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。