结论前置：面对员工不确认工资又要仲裁公司的情况，公司应首先保持冷静，积极应对，通过合法途径解决争议。以下是从不同角度给出的具体分析和建议。
一、法律背景与员工权利
根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的相关规定，员工与用人单位之间因劳动报酬等事项发生争议时，员工有权向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。这意味着，即使员工不确认工资数额，他们仍然有权就工资问题提出仲裁申请。
二、公司应对策略
核实工资记录与合同：
- 公司应首先核实员工的工资记录，包括工资单、银行转账记录等，确保工资发放的准确性和合法性。
- 同时，检查与员工签订的劳动合同，确认其中关于工资的约定是否清晰、明确。
积极沟通与协商：
- 在员工提出仲裁申请前，公司应主动与员工进行沟通，了解员工不确认工资的具体原因。
- 尝试通过协商解决争议，如调整工资数额、补发工资差额等，以避免仲裁程序的启动。
准备应诉材料：
- 如果员工坚持仲裁，公司应积极准备应诉材料，包括工资记录、劳动合同、员工考勤记录等，以证明公司工资发放的合法性和合理性。
- 同时，公司可以委托专业律师代理仲裁案件，提高应诉效率和胜诉率。
三、可能的法律后果
如果公司胜诉：
- 劳动争议仲裁委员会将驳回员工的仲裁请求，公司无需承担额外的法律责任。
- 但公司应注意，即使胜诉，也应保持与员工的良好关系，避免类似争议再次发生。
如果公司败诉：
- 劳动争议仲裁委员会将裁决公司支付员工相应的工资差额或赔偿金。
- 公司应按照裁决结果及时履行支付义务，否则可能面临强制执行等法律后果。
- 同时，公司应反思自身在工资管理方面存在的问题，及时进行整改，以避免类似争议再次发生。
四、预防措施与建议
完善工资管理制度：
- 公司应建立完善的工资管理制度，明确工资计算方式、发放时间等关键要素。
- 定期对工资管理制度进行审查和更新，确保其符合法律法规的要求。
加强员工沟通与培训：
- 公司应加强与员工的沟通，及时了解员工对工资的疑问和诉求。
- 定期对员工进行劳动法律法规的培训，提高员工的法律意识和维权能力。
建立争议解决机制：
- 公司可以建立内部争议解决机制，如设立劳动争议调解委员会等，以便及时、有效地解决员工与用人单位之间的争议。
最后，面对员工不确认工资又要仲裁公司的情况，公司应保持冷静、积极应对，通过合法途径解决争议。如果你或公司在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。