结论：在法院认定了合伙关系的情况下，合伙人任意一方是否可以起诉挂靠运输公司，这并非一个简单的是非问题，而是需要依据具体的法律关系和事实情况来判断。以下是从不同角度进行的分析：

1. 合伙关系与挂靠关系的独立性：

   • 合伙关系是合伙人之间基于共同出资、共同经营、共享收益、共担风险而形成的法律关系。
   • 挂靠关系则是指一方（挂靠方）以另一方（被挂靠方）的名义进行经营活动，并支付一定的挂靠费用。
   • 这两种关系在法律上是独立的，合伙关系的认定并不直接决定合伙人能否起诉挂靠运输公司。

2. 合伙人起诉挂靠运输公司的可能情形：

   • 如果挂靠行为损害了合伙人的利益：例如，挂靠运输公司以被挂靠的名义从事了损害合伙人利益的行为，如挪用资金、违规经营等，那么合伙人作为利益受损方，有权基于侵权或违约等法律关系起诉挂靠运输公司。
   • 如果合伙人与挂靠运输公司之间存在直接的合同关系：例如，合伙人个人与挂靠运输公司签订了运输合同或其他相关合同，且合同中明确约定了双方的权利和义务。在这种情况下，如果挂靠运输公司违反了合同约定，合伙人当然有权起诉挂靠运输公司。
   • 如果合伙协议中有特别约定：合伙协议是合伙人之间约定权利和义务的重要文件。如果合伙协议中明确规定了在某种情况下合伙人可以起诉挂靠运输公司，那么合伙人就有权依据合伙协议的约定进行起诉。

3. 起诉的法律依据和程序：

   • 法律依据：合伙人起诉挂靠运输公司，主要依据的是《中华人民共和国民法典》中关于侵权责任、合同责任等相关规定。
   • 起诉程序：合伙人需要准备充分的证据材料，如合伙协议、挂靠合同、损害证明等，并按照民事诉讼法的规定向法院提起诉讼。在诉讼过程中，合伙人需要积极举证、质证，以维护自己的合法权益。

4. 建议与注意事项：

   • 在起诉前进行充分的法律咨询：由于法律关系的复杂性，合伙人在起诉前最好咨询专业律师，以了解自己的权利和义务以及诉讼的风险和可能的结果。
   • 注意收集和保存证据：证据是诉讼的关键。合伙人需要收集并保存与案件相关的所有证据材料，以便在诉讼过程中证明自己的主张。
   • 考虑诉讼成本和效益：诉讼需要投入一定的时间、精力和金钱。合伙人在决定起诉前需要综合考虑诉讼成本和可能获得的效益，以做出明智的决策。

总结与进一步思考：合伙人任意一方是否可以起诉挂靠运输公司，取决于具体的法律关系和事实情况。在决定起诉前，合伙人需要充分了解自己的权利和义务、收集并保存证据材料、咨询专业律师并综合考虑诉讼成本和效益。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。