针对您提出的“起诉村经济合作社违约，资金在镇里经管站如何执行”的问题，核心在于明确执行对象与执行程序，需分两步走：先通过诉讼确认债权，再依据资金性质申请强制执行。以下从法律程序和实务操作角度为您详细分析：

一、诉讼阶段：确认违约事实与债权

1. 起诉条件
   需满足《民事诉讼法》第122条：原告与案件有直接利害关系（如合同相对方）、有明确被告（村经济合作社）、具体诉讼请求（如支付违约金、赔偿损失）、属于法院管辖范围。
   关键证据：合同文本、资金存放证明（如经管站出具的账户信息）、违约事实证据（如未履行义务的书面通知、沟通记录）。

2. 诉讼策略

   • 若合同明确约定资金存放于经管站账户，可申请法院冻结该账户（诉前保全或诉讼保全），防止资金转移。
     
   • 若合同未明确约定，需证明资金实际归属村经济合作社（如经管站代管协议、资金用途证明），否则可能面临执行障碍。

二、执行阶段：针对经管站账户资金的执行路径

1. 资金性质认定

   • 若资金属于村经济合作社所有（如集体经营收入、补偿款）：
     法院可直接执行经管站账户中对应资金，依据《民事诉讼法》第243条，向经管站发出协助执行通知书，要求划拨至法院账户。
     实务提示：需提供经管站确认资金归属的书面材料，避免与其他村集体资金混淆。
     
   • 若资金属于专项资金或受法律保护（如扶贫款、土地补偿款）：
     可能面临执行限制，需依据《最高人民法院关于执行工作中规范执行行为切实保护各方当事人财产权益的通知》等文件，证明资金非法定保护范围。

2. 执行程序

   • 取得生效判决后，向法院申请强制执行，提交《执行申请书》、判决书、被执行人财产线索（经管站账户信息）。
     
   • 法院向经管站送达《执行裁定书》《协助执行通知书》，要求限期划拨资金。
     
   • 若经管站拒不协助，法院可对其罚款、拘留，甚至追究刑事责任（《刑法》第313条拒不执行判决、裁定罪）。

三、风险防范与实务建议

1. 诉前调查
   通过律师调查令或申请法院调查，核实资金性质、金额及是否存在其他权利人（如共有人、抵押权人），避免执行异议。

2. 协商优先
   若村经济合作社有还款意愿但资金紧张，可协商分期履行或以其他资产（如土地、设备）抵债，降低执行成本。

3. 关注时效
   申请强制执行期限为判决生效后2年内，逾期将丧失执行权利。

总结：起诉村经济合作社违约后，需先通过诉讼确认债权，再根据资金性质申请执行经管站账户。若资金确属合作社所有且无执行限制，法院可直接划拨；若存在争议，需通过证据固定资金归属。建议委托律师协助调查资金性质、制定诉讼策略，以提高执行效率。如有进一步问题，可直接向我咨询具体操作细节。