有执行案子的公司，在特定条件下是可以自己进行清算的，但这一过程会受到法律的严格限制和监管。以下是对这一问题的详细分析：

1. 公司清算的基本条件：

   • 公司清算通常发生在公司解散、破产或被依法责令关闭等情形下。清算的目的是了结公司事务，分配剩余财产，并最终注销公司法人资格。
   • 在公司存在执行案子的情况下，如果公司决定自行清算，必须确保清算过程不会损害债权人的利益，且符合相关法律法规的规定。

2. 执行案子对公司清算的影响：

   • 如果公司存在未了结的执行案子，特别是涉及债务清偿的执行案子，这可能会对公司清算产生重大影响。因为清算过程中需要优先清偿公司的债务，如果债务未得到妥善处理，清算可能无法顺利进行。
   • 在清算过程中，如果发现公司财产不足以清偿全部债务，或者存在其他影响清算的重大障碍，清算组应当及时向人民法院报告，并可能面临转入破产清算程序的风险。

3. 公司自行清算的合法性与程序：

   • 根据《中华人民共和国公司法》及相关司法解释的规定，公司可以在符合法定条件的情况下自行组织清算。这通常要求公司成立清算组，负责清算事务的办理。
   • 在清算过程中，清算组应当依法履行通知债权人、公告、清理公司财产、编制资产负债表和财产清单、制定清算方案等职责。同时，清算组的行为受到法律的严格监督，任何违法行为都可能承担法律责任。

4. 执行案子与公司清算的协调：

   • 如果公司存在执行案子，且决定自行清算，建议公司在清算前与执行法院进行沟通，了解执行案子的具体情况和可能的影响。
   • 在清算过程中，清算组应当积极配合执行法院的工作，确保清算与执行程序的协调进行。如果清算过程中发现公司财产不足以清偿执行案子的债务，清算组应当及时向执行法院报告，并按照法院的指示进行处理。

5. 法律建议：

   • 对于存在执行案子的公司而言，自行清算可能是一个复杂且风险较高的过程。因此，建议公司在决定自行清算前，充分评估自身的财务状况和法律风险，并咨询专业律师的意见。
   • 如果公司确实需要自行清算，应当确保清算过程的合法性和透明度，积极履行清算组的职责，并妥善处理与执行案子相关的问题，以避免可能的法律纠纷和损失。

总结来说，有执行案子的公司在特定条件下是可以自己进行清算的，但这一过程需要严格遵守相关法律法规的规定，并确保清算过程的合法性和透明度。如果公司在清算过程中遇到任何问题或困难，建议及时咨询专业律师以获取法律帮助。